54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2678 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2678  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 318 aa  654    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.159389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3245  UspA domain-containing protein  26.93 
 
 		 314 aa  86.3  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0650  UspA domain-containing protein  23.82 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3226  UspA domain-containing protein  24.16 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1237  hypothetical protein  22.47 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.454178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1866  UspA domain-containing protein  22.33 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1042  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0801176  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2870  UspA domain-containing protein  25.38 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0181  UspA domain-containing protein  33.75 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.243572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1790  UspA domain-containing protein  27.16 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238158  normal  0.669645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1330  UspA domain-containing protein  24.52 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1290  UspA domain-containing protein  24.44 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.85216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  30.91 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0048  hypothetical protein  20.44 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0534  UspA domain protein  30.52 
 
 		 151 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1331  UspA domain-containing protein  22.88 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0701  UspA domain protein  25.96 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0808  UspA domain-containing protein  28.66 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.188689  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0159  UspA domain-containing protein  29.56 
 
 		 157 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  32.41 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1329  UspA domain-containing protein  25.16 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  28.67 
 
 		 146 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  27.03 
 
 		 159 aa  51.2  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  28 
 
 		 145 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2228  UspA domain-containing protein  22.06 
 
 		 278 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.424583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 139 aa  49.7  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 142 aa  48.5  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2062  UspA domain protein  25 
 
 		 163 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2375  UspA domain protein  29.17 
 
 		 169 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.561206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  29.93 
 
 		 145 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  21.54 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  21.5 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  23.18 
 
 		 141 aa  46.2  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  27.52 
 
 		 142 aa  46.2  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  26.52 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  26.32 
 
 		 140 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  27.74 
 
 		 162 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  24.02 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1177  UspA domain protein  30.77 
 
 		 211 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368824  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  30.3 
 
 		 151 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  30.3 
 
 		 151 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  21.02 
 
 		 145 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 		 142 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1409  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  52.27 
 
 		 152 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.108766  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  26 
 
 		 137 aa  43.9  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  25.49 
 
 		 143 aa  43.9  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 142 aa  43.9  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  25.46 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0944  UspA domain-containing protein  25.79 
 
 		 140 aa  43.1  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1288  UspA domain protein  23.23 
 
 		 292 aa  42.7  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.428871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 291 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4155  UspA domain-containing protein  28.78 
 
 		 176 aa  42.7  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  21.33 
 
 		 320 aa  42.4  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>