35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3245 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3245  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 314 aa  629  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3226  UspA domain-containing protein  49.84 
 
 		 313 aa  305  6e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1290  UspA domain-containing protein  46.43 
 
 		 313 aa  279  6e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.85216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0650  UspA domain-containing protein  43.61 
 
 		 323 aa  263  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0808  UspA domain-containing protein  45.81 
 
 		 309 aa  259  5.0000000000000005e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.188689  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1790  UspA domain-containing protein  43.18 
 
 		 310 aa  256  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238158  normal  0.669645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1330  UspA domain-containing protein  36.57 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1331  UspA domain-containing protein  33.23 
 
 		 303 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1329  UspA domain-containing protein  31.02 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1866  UspA domain-containing protein  29.11 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2678  UspA domain-containing protein  26.93 
 
 		 318 aa  86.3  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.159389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1042  UspA domain-containing protein  35.06 
 
 		 150 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0801176  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0534  UspA domain protein  29.68 
 
 		 151 aa  68.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1288  UspA domain protein  23.51 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.428871 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2062  UspA domain protein  30.86 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0701  UspA domain protein  23.89 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2375  UspA domain protein  29.89 
 
 		 169 aa  62  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.561206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0159  UspA domain-containing protein  27.1 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1237  hypothetical protein  20.75 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.454178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0181  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.243572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0048  hypothetical protein  23.19 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2477  UspA domain-containing protein  27.39 
 
 		 159 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.65519  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2228  UspA domain-containing protein  24.05 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.424583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0497  UspA domain protein  23.45 
 
 		 310 aa  53.5  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 145 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  29.58 
 
 		 139 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2870  UspA domain-containing protein  21.52 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2777  hypothetical protein  25 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  28.37 
 
 		 139 aa  47.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  27.14 
 
 		 141 aa  46.2  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  30.94 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  27.63 
 
 		 140 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1177  UspA domain protein  28 
 
 		 211 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368824  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  27.88 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>