63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0534 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0534  UspA domain protein  100 
 
 		 151 aa  306  5.9999999999999995e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0650  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 		 323 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0159  UspA domain-containing protein  31.17 
 
 		 157 aa  83.6  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1790  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238158  normal  0.669645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3245  UspA domain-containing protein  29.68 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3226  UspA domain-containing protein  30.92 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1290  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.85216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1866  UspA domain-containing protein  31.41 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2678  UspA domain-containing protein  30.52 
 
 		 318 aa  61.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.159389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0808  UspA domain-containing protein  27.67 
 
 		 309 aa  61.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.188689  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2062  UspA domain protein  27.88 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2375  UspA domain protein  26.47 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.561206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1331  UspA domain-containing protein  36.78 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1042  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0801176  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0181  UspA domain-containing protein  29.56 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.243572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  30.67 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1330  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 		 307 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1329  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 307 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  26.67 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  30.14 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  30.39 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  28.57 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  34.62 
 
 		 305 aa  47.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  28.57 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  33.75 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  29.33 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  28.87 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  33.75 
 
 		 283 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0944  UspA domain-containing protein  28.1 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  27.66 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  29.14 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  27.78 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1559  UspA domain protein  27.56 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.411505 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  27.03 
 
 		 157 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  28.39 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  22.7 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  27.03 
 
 		 180 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  39.34 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  26.85 
 
 		 177 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  28.37 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0646  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  26.85 
 
 		 140 aa  41.2  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  28.57 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 140 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  26.9 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  29.38 
 
 		 157 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  27.66 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  27.27 
 
 		 277 aa  40.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  29.38 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  36.11 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  47.62 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2870  UspA domain-containing protein  24.36 
 
 		 288 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0701  UspA domain protein  24.34 
 
 		 288 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  29.37 
 
 		 149 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>