30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1177 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1177  UspA domain protein  100 
 
 		 211 aa  424  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368824  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0159  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906584  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2375  UspA domain protein  31.28 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.561206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1042  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 150 aa  62  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0801176  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1329  UspA domain-containing protein  26.49 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2062  UspA domain protein  30.99 
 
 		 163 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3226  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 313 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  30.86 
 
 		 142 aa  51.6  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0650  UspA domain-containing protein  24.39 
 
 		 323 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1331  UspA domain-containing protein  24.22 
 
 		 303 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1330  UspA domain-containing protein  26.15 
 
 		 307 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1290  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 		 313 aa  49.3  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.85216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.39 
 
 		 145 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  29.63 
 
 		 151 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  30.63 
 
 		 141 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  28.57 
 
 		 141 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0701  UspA domain protein  25.97 
 
 		 288 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3245  UspA domain-containing protein  24.55 
 
 		 314 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2678  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 318 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.159389 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1288  UspA domain protein  27.33 
 
 		 292 aa  42.4  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.428871 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1790  UspA domain-containing protein  26.32 
 
 		 310 aa  42.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238158  normal  0.669645 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  26.92 
 
 		 152 aa  42.4  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0808  UspA domain-containing protein  23.46 
 
 		 309 aa  42.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.188689  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1866  UspA domain-containing protein  24.84 
 
 		 310 aa  42.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  26.67 
 
 		 143 aa  42  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  25.32 
 
 		 149 aa  41.6  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  29.61 
 
 		 150 aa  41.6  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2777  hypothetical protein  27.11 
 
 		 307 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1796  UspA domain-containing protein  26.14 
 
 		 137 aa  41.6  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1762  UspA domain-containing protein  26.14 
 
 		 137 aa  41.6  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>