20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2777 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2777  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  622  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2228  UspA domain-containing protein  62.21 
 
 
278 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.424583  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2827  hypothetical protein  39.09 
 
 
275 aa  202  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1288  UspA domain protein  35.94 
 
 
292 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.428871 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0701  UspA domain protein  35.56 
 
 
288 aa  157  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2870  UspA domain-containing protein  35.56 
 
 
288 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0497  UspA domain protein  29.65 
 
 
310 aa  87.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1866  UspA domain-containing protein  25.3 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0048  hypothetical protein  24.75 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0808  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.188689  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1790  UspA domain-containing protein  26.11 
 
 
310 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238158  normal  0.669645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3226  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 
313 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1237  hypothetical protein  24.92 
 
 
313 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.454178  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1330  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1290  UspA domain-containing protein  26.85 
 
 
313 aa  55.8  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.85216  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1329  UspA domain-containing protein  35.11 
 
 
307 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0159  UspA domain-containing protein  25.85 
 
 
157 aa  52.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906584  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1331  UspA domain-containing protein  24.9 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3245  UspA domain-containing protein  25 
 
 
314 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0650  UspA domain-containing protein  27.75 
 
 
323 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>