26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5187 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5187  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  100 
 
 		 140 aa  292  9e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0606  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  67.54 
 
 		 161 aa  177  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1641  ferredoxin thioredoxin reductase, beta chain  51.65 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.872315  normal  0.552751 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4385  ferredoxin thioredoxin reductase subunit beta  50.55 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3748  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  47.73 
 
 		 117 aa  94.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.668578 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2283  ferredoxin thioredoxin reductase, catalytic beta chain  45.05 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.119617 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0403  ferredoxin thioredoxin reductase, catalytic beta chain  46.15 
 
 		 118 aa  90.9  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1734  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic chain  50 
 
 		 120 aa  90.1  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.837813 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1567  ferredoxin thioredoxin reductase, beta chain  49.41 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.380841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1550  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  47.78 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.671529 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1523  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  47.78 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2504  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  46.59 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.859232 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18254  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  48.78 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50907  reductase of ferredoxin thioredoxin reductase  42.05 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  31.82 
 
 		 241 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2203  thioredoxin-related protein  32.97 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0831  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  32.65 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.45968  normal  0.308889 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1252  hypothetical protein  29.59 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.026708  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0211  hypothetical protein  30.12 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0907  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  28.57 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000583503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2432  rubredoxin  29.7 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000792123  normal  0.129833 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2920  hypothetical protein  30.95 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.927487  hitchhiker  0.000209703 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  29.47 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00592628  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1842  hypothetical protein  26.97 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102769  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0980  thioredoxin-related protein  28.05 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.744067  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2454  rubredoxin  29.03 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>