26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2934 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2934  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  239  7e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.180686 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2738  hypothetical protein  71.05 
 
 		 114 aa  184  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849161  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2100  hypothetical protein  70.18 
 
 		 114 aa  180  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.375211 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1407  hypothetical protein  66.98 
 
 		 119 aa  161  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0077  hypothetical protein  63.3 
 
 		 116 aa  152  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0349  hypothetical protein  61.32 
 
 		 111 aa  147  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2967  hypothetical protein  59.81 
 
 		 110 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000688679  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0927  putative ferredoxin-thioredoxin reductase,catalyticsubunit  51.82 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.091769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.48 
 
 		 172 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0831  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.5 
 
 		 171 aa  103  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.45968  normal  0.308889 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2432  rubredoxin  46.08 
 
 		 167 aa  103  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000792123  normal  0.129833 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0907  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48 
 
 		 163 aa  101  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000583503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_187  rubredoxin-type iron-sulfur protein  48.98 
 
 		 168 aa  99  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000349376  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0199  ferredoxin-thioredoxin reductase, catalytic subunit, putative/rubredoxin  48.57 
 
 		 168 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.53 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00592628  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2454  rubredoxin  48.89 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1842  hypothetical protein  45.83 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102769  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  32.18 
 
 		 241 aa  72  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2203  thioredoxin-related protein  40.26 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2920  hypothetical protein  35.8 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.927487  hitchhiker  0.000209703 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2384  hypothetical protein  36.59 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0980  thioredoxin-related protein  38.81 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.744067  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0211  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1252  hypothetical protein  30.12 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.026708  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0305  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic subunit-like protein  37.33 
 
 		 582 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1374  rhodanese-like protein  27.84 
 
 		 245 aa  41.2  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0706791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>