33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0980 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0980  thioredoxin-related protein  100 
 
 		 95 aa  202  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.744067  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2203  thioredoxin-related protein  59.34 
 
 		 93 aa  115  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1842  hypothetical protein  65 
 
 		 92 aa  114  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102769  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1252  hypothetical protein  56.25 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.026708  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2920  hypothetical protein  56.41 
 
 		 93 aa  107  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.927487  hitchhiker  0.000209703 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  53.75 
 
 		 241 aa  103  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0831  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.24 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.45968  normal  0.308889 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.18 
 
 		 172 aa  73.6  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0907  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000583503  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0349  hypothetical protein  41.18 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2967  hypothetical protein  44.12 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000688679  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0199  ferredoxin-thioredoxin reductase, catalytic subunit, putative/rubredoxin  41.33 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0211  hypothetical protein  43.28 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2454  rubredoxin  45.45 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2384  hypothetical protein  41.67 
 
 		 91 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2738  hypothetical protein  35.8 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849161  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1407  hypothetical protein  39.71 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.73 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00592628  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0077  hypothetical protein  36.76 
 
 		 116 aa  67  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_187  rubredoxin-type iron-sulfur protein  38.67 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000349376  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0927  putative ferredoxin-thioredoxin reductase,catalyticsubunit  38.36 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.091769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2432  rubredoxin  38.24 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000792123  normal  0.129833 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2934  hypothetical protein  38.81 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.180686 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2100  hypothetical protein  32.35 
 
 		 114 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.375211 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1374  rhodanese-like protein  40.3 
 
 		 245 aa  51.6  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0706791  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0305  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic subunit-like protein  35.29 
 
 		 582 aa  50.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0733  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  32.58 
 
 		 247 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168606  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50907  reductase of ferredoxin thioredoxin reductase  30.23 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2504  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  28.57 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.859232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5187  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  28.05 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2283  ferredoxin thioredoxin reductase, catalytic beta chain  30.49 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.119617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1567  ferredoxin thioredoxin reductase, beta chain  30.95 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.380841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1734  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic chain  29.63 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.837813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>