More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0334 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  100 
 
 		 241 aa  499  1e-140  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2920  hypothetical protein  62.64 
 
 		 93 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.927487  hitchhiker  0.000209703 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2203  thioredoxin-related protein  53.26 
 
 		 93 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1842  hypothetical protein  50.56 
 
 		 92 aa  105  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102769  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1252  hypothetical protein  47.62 
 
 		 96 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.026708  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0980  thioredoxin-related protein  53.75 
 
 		 95 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.744067  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  39.6 
 
 		 110 aa  89  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  41.75 
 
 		 107 aa  88.6  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  41.67 
 
 		 110 aa  87.8  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  38.78 
 
 		 108 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  37.62 
 
 		 105 aa  85.9  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  39.58 
 
 		 107 aa  84  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  42.39 
 
 		 102 aa  83.6  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  34.26 
 
 		 108 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  37.63 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  36.46 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_56519  predicted protein  32.65 
 
 		 700 aa  81.3  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  34.65 
 
 		 105 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  34.34 
 
 		 107 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  34.34 
 
 		 107 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  36.96 
 
 		 106 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  33.94 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  38.54 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  33.96 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  32.98 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  31.96 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  34.15 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  32.04 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  36.08 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  37.63 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  34.02 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  34.65 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  33.33 
 
 		 106 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  34.95 
 
 		 110 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  36.19 
 
 		 108 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  34.38 
 
 		 110 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  31.43 
 
 		 108 aa  77.4  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  37.11 
 
 		 107 aa  77  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  36.46 
 
 		 120 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  35.23 
 
 		 145 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  36.27 
 
 		 110 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  35.42 
 
 		 115 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  37.11 
 
 		 108 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  34.09 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  29.63 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  31.53 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  40 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  32.32 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  33.33 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  31.13 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  35.66 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  34.65 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0199  ferredoxin-thioredoxin reductase, catalytic subunit, putative/rubredoxin  45.07 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2247  thioredoxin  32.29 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203984  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  33.7 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  31.73 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  33.7 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  31.25 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  34.29 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  37.08 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  32.98 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0211  hypothetical protein  42.86 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  36.08 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  34.04 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  30.61 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  33.7 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  36.05 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  35.42 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  36.05 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  35.96 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  36.71 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  35.42 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  37.36 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  32.08 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  36.08 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  31.37 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.66 
 
 		 167 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00592628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  31.86 
 
 		 160 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  36.17 
 
 		 108 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  34.69 
 
 		 109 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  41.98 
 
 		 110 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  32.61 
 
 		 107 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  36.17 
 
 		 108 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  32.26 
 
 		 146 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  37.36 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  32.98 
 
 		 108 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  36.71 
 
 		 145 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  37.36 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  33.33 
 
 		 106 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0349  hypothetical protein  33.72 
 
 		 111 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  32.63 
 
 		 108 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  34.38 
 
 		 108 aa  74.3  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  37.11 
 
 		 108 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  32.61 
 
 		 107 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>