More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2247 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2247  thioredoxin  100 
 
 		 113 aa  231  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203984  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2157  thioredoxin  97.35 
 
 		 113 aa  228  2e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.336694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  72.07 
 
 		 113 aa  174  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  63.3 
 
 		 109 aa  149  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  55.56 
 
 		 111 aa  136  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  53.7 
 
 		 133 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  52.78 
 
 		 110 aa  134  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  54.29 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  51.85 
 
 		 110 aa  131  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  50.93 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  52.34 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  50.93 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  54.63 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  52.38 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  50.93 
 
 		 110 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  51.89 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  50.96 
 
 		 108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  49.07 
 
 		 110 aa  127  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  49.07 
 
 		 110 aa  127  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  50 
 
 		 110 aa  126  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  52.78 
 
 		 108 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  52.78 
 
 		 108 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  52.78 
 
 		 108 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  50.93 
 
 		 108 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  49.54 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  49.54 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  49.54 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  49.54 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  49.54 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  49.54 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  49.54 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  49.54 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  50.48 
 
 		 108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  49.54 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  49.54 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  49.54 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  49.54 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  49.54 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  49.54 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  51.43 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  50.48 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  54.21 
 
 		 109 aa  124  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  49.53 
 
 		 109 aa  124  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  49.54 
 
 		 109 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  49.04 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  50.98 
 
 		 107 aa  124  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  123  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  49.53 
 
 		 109 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  49.53 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  49.52 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  49.53 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  48.15 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  47.62 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  51.43 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  50.48 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  49.52 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  50.48 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5457  thioredoxin  49.04 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  50.48 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  50.48 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  50.48 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  50.48 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  50.48 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  50.48 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  48.57 
 
 		 108 aa  121  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  47.22 
 
 		 110 aa  121  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  120  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  120  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  47.62 
 
 		 108 aa  120  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  47.62 
 
 		 108 aa  120  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  120  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  120  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  49.04 
 
 		 116 aa  120  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  50.93 
 
 		 108 aa  120  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  46.36 
 
 		 110 aa  120  9e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  47.22 
 
 		 146 aa  120  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  119  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  47.22 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5243  thioredoxin  49.04 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  47.22 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  50 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  47.22 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  47.22 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  47.22 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  47.22 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  47.22 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>