35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0154 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 		 167 aa  342  1e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00592628  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0199  ferredoxin-thioredoxin reductase, catalytic subunit, putative/rubredoxin  80.84 
 
 		 168 aa  286  8e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_187  rubredoxin-type iron-sulfur protein  79.04 
 
 		 168 aa  272  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000349376  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0907  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.29 
 
 		 163 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000583503  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2454  rubredoxin  59.74 
 
 		 157 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0831  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.39 
 
 		 171 aa  189  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.45968  normal  0.308889 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0927  putative ferredoxin-thioredoxin reductase,catalyticsubunit  59.33 
 
 		 167 aa  186  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.091769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2432  rubredoxin  56.52 
 
 		 167 aa  186  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000792123  normal  0.129833 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.18 
 
 		 172 aa  174  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0077  hypothetical protein  53.68 
 
 		 116 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0349  hypothetical protein  54.26 
 
 		 111 aa  105  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2967  hypothetical protein  51.58 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000688679  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1407  hypothetical protein  47.92 
 
 		 119 aa  100  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2738  hypothetical protein  45.54 
 
 		 114 aa  100  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849161  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2100  hypothetical protein  44.44 
 
 		 114 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.375211 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2934  hypothetical protein  46.53 
 
 		 114 aa  98.2  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.180686 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  43.66 
 
 		 241 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2203  thioredoxin-related protein  42.25 
 
 		 93 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2384  hypothetical protein  41.25 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1842  hypothetical protein  38.82 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102769  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2920  hypothetical protein  37.33 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.927487  hitchhiker  0.000209703 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0980  thioredoxin-related protein  39.73 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.744067  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1252  hypothetical protein  36.99 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.026708  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0211  hypothetical protein  37.33 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0305  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic subunit-like protein  34.15 
 
 		 582 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  43.08 
 
 		 190 aa  47.8  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1529  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 		 209 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00138894  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0606  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  30.51 
 
 		 161 aa  44.3  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  39.06 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5187  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  29.47 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24760  conserved protein of DIM6/NTAB family  50 
 
 		 229 aa  42.4  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  50 
 
 		 177 aa  42  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  48.39 
 
 		 392 aa  41.2  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  34.92 
 
 		 191 aa  40.8  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  57.58 
 
 		 191 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>