27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0606 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0606  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  100 
 
 		 161 aa  331  3e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5187  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  67.54 
 
 		 140 aa  177  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1641  ferredoxin thioredoxin reductase, beta chain  47.06 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.872315  normal  0.552751 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3748  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  45.24 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.668578 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1550  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  46.99 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.671529 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1523  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  46.99 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18254  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  46.91 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4385  ferredoxin thioredoxin reductase subunit beta  44.05 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2283  ferredoxin thioredoxin reductase, catalytic beta chain  42.22 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.119617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2504  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  46.34 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.859232 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0403  ferredoxin thioredoxin reductase, catalytic beta chain  41.3 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1734  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic chain  45.12 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.837813 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1567  ferredoxin thioredoxin reductase, beta chain  43.9 
 
 		 121 aa  73.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.380841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50907  reductase of ferredoxin thioredoxin reductase  43.21 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2203  thioredoxin-related protein  35.8 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  38.55 
 
 		 241 aa  53.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2920  hypothetical protein  32.56 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.927487  hitchhiker  0.000209703 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2432  rubredoxin  31.68 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000792123  normal  0.129833 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0907  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  27.17 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000583503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  30.51 
 
 		 167 aa  44.3  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00592628  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0211  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  44.3  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1374  rhodanese-like protein  35.87 
 
 		 245 aa  43.9  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0706791  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0831  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  29.79 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.45968  normal  0.308889 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1842  hypothetical protein  32.61 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102769  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1252  hypothetical protein  29.17 
 
 		 96 aa  42.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.026708  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0733  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  30.77 
 
 		 247 aa  41.6  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168606  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_187  rubredoxin-type iron-sulfur protein  29.59 
 
 		 168 aa  40.8  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000349376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>