34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1252 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1252  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  203  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.026708  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1842  hypothetical protein  56.1 
 
 		 92 aa  110  9e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102769  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0980  thioredoxin-related protein  56.25 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.744067  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2203  thioredoxin-related protein  52.33 
 
 		 93 aa  108  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  47.62 
 
 		 241 aa  103  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2920  hypothetical protein  42.35 
 
 		 93 aa  90.5  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.927487  hitchhiker  0.000209703 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0211  hypothetical protein  39.08 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2384  hypothetical protein  38.82 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0831  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.73 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.45968  normal  0.308889 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0927  putative ferredoxin-thioredoxin reductase,catalyticsubunit  39.19 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.091769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0349  hypothetical protein  37.84 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2454  rubredoxin  42.03 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2738  hypothetical protein  31.82 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849161  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.79 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0907  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.03 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000583503  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1407  hypothetical protein  33.72 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0199  ferredoxin-thioredoxin reductase, catalytic subunit, putative/rubredoxin  30.53 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2934  hypothetical protein  30.12 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.180686 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0077  hypothetical protein  31.82 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  36.99 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00592628  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2967  hypothetical protein  34.72 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000688679  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_187  rubredoxin-type iron-sulfur protein  35.62 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000349376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2432  rubredoxin  35.62 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000792123  normal  0.129833 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1374  rhodanese-like protein  38.16 
 
 		 245 aa  57  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0706791  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2100  hypothetical protein  27.27 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.375211 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0305  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic subunit-like protein  32.05 
 
 		 582 aa  52  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0733  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  32.47 
 
 		 247 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168606  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5187  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  29.59 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2283  ferredoxin thioredoxin reductase, catalytic beta chain  34.07 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.119617 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0403  ferredoxin thioredoxin reductase, catalytic beta chain  32.97 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2504  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  31.46 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.859232 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0606  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  29.17 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1734  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic chain  29.55 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.837813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1641  ferredoxin thioredoxin reductase, beta chain  28.74 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.872315  normal  0.552751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>