26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2100 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2100  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  241  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.375211 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2934  hypothetical protein  70.18 
 
 		 114 aa  180  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.180686 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2738  hypothetical protein  68.42 
 
 		 114 aa  176  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849161  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1407  hypothetical protein  64.81 
 
 		 119 aa  167  6e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0349  hypothetical protein  63.21 
 
 		 111 aa  152  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0077  hypothetical protein  60.55 
 
 		 116 aa  148  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2967  hypothetical protein  59.81 
 
 		 110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000688679  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.54 
 
 		 172 aa  111  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2432  rubredoxin  45.19 
 
 		 167 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000792123  normal  0.129833 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0831  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.87 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.45968  normal  0.308889 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0907  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.93 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000583503  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2454  rubredoxin  52.22 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0927  putative ferredoxin-thioredoxin reductase,catalyticsubunit  47.27 
 
 		 167 aa  103  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.091769  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0199  ferredoxin-thioredoxin reductase, catalytic subunit, putative/rubredoxin  46.3 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.44 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00592628  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_187  rubredoxin-type iron-sulfur protein  47.96 
 
 		 168 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000349376  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1842  hypothetical protein  40.85 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102769  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  30.68 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2920  hypothetical protein  35.8 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.927487  hitchhiker  0.000209703 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2203  thioredoxin-related protein  31.4 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0305  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic subunit-like protein  32.18 
 
 		 582 aa  62  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2384  hypothetical protein  32.53 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0211  hypothetical protein  32.56 
 
 		 98 aa  60.1  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0980  thioredoxin-related protein  32.35 
 
 		 95 aa  60.1  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.744067  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1252  hypothetical protein  27.27 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.026708  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1374  rhodanese-like protein  25.96 
 
 		 245 aa  41.6  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0706791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>