25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0077 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0077  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  239  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1407  hypothetical protein  73.21 
 
 		 119 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0349  hypothetical protein  70.64 
 
 		 111 aa  166  9e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2967  hypothetical protein  65.74 
 
 		 110 aa  158  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000688679  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2738  hypothetical protein  62.73 
 
 		 114 aa  157  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849161  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2934  hypothetical protein  63.3 
 
 		 114 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.180686 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2100  hypothetical protein  60.55 
 
 		 114 aa  148  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.375211 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0907  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56 
 
 		 163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000583503  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0199  ferredoxin-thioredoxin reductase, catalytic subunit, putative/rubredoxin  55.45 
 
 		 168 aa  117  7e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2454  rubredoxin  60.67 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2432  rubredoxin  49.04 
 
 		 167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000792123  normal  0.129833 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.68 
 
 		 167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00592628  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0927  putative ferredoxin-thioredoxin reductase,catalyticsubunit  54.84 
 
 		 167 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.091769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_187  rubredoxin-type iron-sulfur protein  52.04 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000349376  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0831  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.98 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.45968  normal  0.308889 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1842  hypothetical protein  36.9 
 
 		 92 aa  70.1  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102769  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  32.18 
 
 		 241 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2203  thioredoxin-related protein  34.88 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0980  thioredoxin-related protein  36.76 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.744067  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0305  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic subunit-like protein  36.47 
 
 		 582 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2920  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.927487  hitchhiker  0.000209703 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1252  hypothetical protein  31.82 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.026708  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0211  hypothetical protein  35.23 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2384  hypothetical protein  35.37 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>