18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0403 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0403  ferredoxin thioredoxin reductase, catalytic beta chain  100 
 
 		 118 aa  247  4e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2283  ferredoxin thioredoxin reductase, catalytic beta chain  92.37 
 
 		 118 aa  231  3e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.119617 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4385  ferredoxin thioredoxin reductase subunit beta  70.8 
 
 		 121 aa  173  7e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1734  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic chain  75.47 
 
 		 120 aa  173  7e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.837813 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1523  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  67.86 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3748  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  68.27 
 
 		 117 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.668578 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1550  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  67.86 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.671529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1641  ferredoxin thioredoxin reductase, beta chain  64.6 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.872315  normal  0.552751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1567  ferredoxin thioredoxin reductase, beta chain  66.98 
 
 		 121 aa  158  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.380841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2504  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  65.14 
 
 		 119 aa  157  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.859232 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18254  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  73.12 
 
 		 103 aa  155  3e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50907  reductase of ferredoxin thioredoxin reductase  54 
 
 		 160 aa  120  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5187  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  46.15 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0606  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  42.05 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1842  hypothetical protein  35.56 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102769  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1252  hypothetical protein  32.97 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.026708  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  29.79 
 
 		 241 aa  44.3  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2203  thioredoxin-related protein  30.21 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>