More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_56519 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_56519  predicted protein  100 
 
 		 700 aa  1435    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532885  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  47.26 
 
 		 345 aa  292  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  48.31 
 
 		 311 aa  290  6e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  45.91 
 
 		 338 aa  283  6.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  47.87 
 
 		 324 aa  283  7.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  47.38 
 
 		 321 aa  281  3e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  46.77 
 
 		 321 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  44.65 
 
 		 324 aa  278  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  46.34 
 
 		 324 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  45.24 
 
 		 321 aa  276  6e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  47.08 
 
 		 321 aa  276  8e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  46.46 
 
 		 319 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  45.29 
 
 		 322 aa  275  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  46.34 
 
 		 324 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  44.67 
 
 		 323 aa  275  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  45.23 
 
 		 311 aa  274  4.0000000000000004e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1664  thioredoxin reductase  48.16 
 
 		 324 aa  273  8.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28715  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  45.26 
 
 		 312 aa  273  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  45.26 
 
 		 317 aa  273  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  48.48 
 
 		 336 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  45.05 
 
 		 325 aa  272  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  43.42 
 
 		 335 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  46.96 
 
 		 335 aa  271  4e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1499  thioredoxin reductase  47.24 
 
 		 324 aa  270  5e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.770592  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0981  thioredoxin-disulfide reductase  44.31 
 
 		 317 aa  268  2e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.708131  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  44.44 
 
 		 361 aa  268  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  45.54 
 
 		 320 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  46.04 
 
 		 333 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  47.24 
 
 		 332 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  46.04 
 
 		 333 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  46.04 
 
 		 333 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  45.76 
 
 		 314 aa  267  4e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  44.78 
 
 		 326 aa  267  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  45.76 
 
 		 314 aa  268  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  44.62 
 
 		 311 aa  267  5e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  46.04 
 
 		 320 aa  265  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  45.9 
 
 		 310 aa  264  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  43.69 
 
 		 311 aa  264  3e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  45.26 
 
 		 332 aa  265  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  46.63 
 
 		 321 aa  264  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  45.15 
 
 		 310 aa  263  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  43.47 
 
 		 326 aa  263  6.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  46.32 
 
 		 321 aa  263  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  43.06 
 
 		 334 aa  263  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  42.9 
 
 		 324 aa  262  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  44.57 
 
 		 339 aa  263  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  44.51 
 
 		 330 aa  262  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  46.32 
 
 		 321 aa  262  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  44.62 
 
 		 311 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  44.92 
 
 		 311 aa  261  4e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  44.31 
 
 		 319 aa  261  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  44.98 
 
 		 310 aa  261  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  44.28 
 
 		 346 aa  260  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  44.07 
 
 		 318 aa  260  6e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  44.31 
 
 		 310 aa  260  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  43.16 
 
 		 327 aa  260  7e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  42.9 
 
 		 324 aa  260  7e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  45.71 
 
 		 321 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  44.11 
 
 		 330 aa  259  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  43.38 
 
 		 311 aa  259  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  45.11 
 
 		 330 aa  259  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  46.01 
 
 		 313 aa  259  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  42.6 
 
 		 324 aa  258  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  43.37 
 
 		 314 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  45.05 
 
 		 325 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  44.04 
 
 		 320 aa  258  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  43.94 
 
 		 318 aa  258  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  48.19 
 
 		 325 aa  258  4e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  46.65 
 
 		 331 aa  258  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  42.07 
 
 		 353 aa  257  5e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  47.87 
 
 		 317 aa  257  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0563  thioredoxin reductase  44.11 
 
 		 326 aa  257  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0552475  normal  0.0148693 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  45.26 
 
 		 340 aa  256  7e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  44.74 
 
 		 361 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  45.4 
 
 		 334 aa  256  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1633  thioredoxin reductase  41.46 
 
 		 349 aa  256  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  45.4 
 
 		 335 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  45.02 
 
 		 322 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  44.04 
 
 		 348 aa  255  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  42.53 
 
 		 331 aa  255  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  45.4 
 
 		 314 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  42.02 
 
 		 331 aa  254  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  42.47 
 
 		 319 aa  253  9.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  41.77 
 
 		 316 aa  253  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  43.9 
 
 		 359 aa  252  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  44.38 
 
 		 332 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  45.45 
 
 		 314 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  43.35 
 
 		 327 aa  251  4e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1450  thioredoxin-disulfide reductase  47.55 
 
 		 324 aa  251  5e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  42.86 
 
 		 313 aa  250  5e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  44.41 
 
 		 333 aa  249  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  42.81 
 
 		 313 aa  249  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  41.59 
 
 		 315 aa  248  2e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  41.91 
 
 		 458 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  43.6 
 
 		 314 aa  247  4e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  39.94 
 
 		 326 aa  248  4e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  43.2 
 
 		 318 aa  247  6.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  42.55 
 
 		 311 aa  246  6.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0735  thioredoxin-disulfide reductase  42.82 
 
 		 318 aa  246  9.999999999999999e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0331  thioredoxin reductase  42.27 
 
 		 321 aa  244  3e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>