More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0056 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  100 
 
 		 326 aa  672    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  77.29 
 
 		 326 aa  521  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  70.46 
 
 		 325 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  73.44 
 
 		 324 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  73.11 
 
 		 324 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  72.46 
 
 		 324 aa  472  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  71.08 
 
 		 325 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  68.54 
 
 		 324 aa  465  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  67.21 
 
 		 321 aa  461  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  67.53 
 
 		 321 aa  461  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  69.48 
 
 		 321 aa  463  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0563  thioredoxin reductase  70.19 
 
 		 326 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0552475  normal  0.0148693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  67.92 
 
 		 321 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  67.51 
 
 		 338 aa  454  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1499  thioredoxin reductase  69.35 
 
 		 324 aa  451  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.770592  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  67.61 
 
 		 321 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1664  thioredoxin reductase  68.42 
 
 		 324 aa  448  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28715  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  67.96 
 
 		 324 aa  447  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  68.93 
 
 		 324 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  67.64 
 
 		 324 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  66.35 
 
 		 321 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  69.18 
 
 		 334 aa  443  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  66.04 
 
 		 321 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  65.91 
 
 		 320 aa  430  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  66.88 
 
 		 314 aa  428  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1450  thioredoxin-disulfide reductase  69.23 
 
 		 324 aa  427  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0981  thioredoxin-disulfide reductase  64.08 
 
 		 317 aa  418  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.708131  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  65 
 
 		 335 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  61.18 
 
 		 345 aa  412  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  63.61 
 
 		 332 aa  403  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  61.04 
 
 		 331 aa  398  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  61.61 
 
 		 321 aa  398  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  64.69 
 
 		 314 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  60.66 
 
 		 312 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  60.66 
 
 		 317 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  60.51 
 
 		 322 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  60.39 
 
 		 335 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  60.33 
 
 		 313 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  58.31 
 
 		 314 aa  381  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  58.09 
 
 		 323 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  57.78 
 
 		 317 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  59.61 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  58.41 
 
 		 320 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  56.37 
 
 		 317 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  58.1 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  57.78 
 
 		 346 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  56.51 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0791  thioredoxin reductase  57.32 
 
 		 321 aa  366  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  57.46 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0703  thioredoxin reductase  57.63 
 
 		 321 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  56.51 
 
 		 346 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  58.1 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  57.46 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  57.46 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2601  thioredoxin reductase  57.19 
 
 		 321 aa  364  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  57.32 
 
 		 323 aa  363  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2342  thioredoxin reductase oxidoreductase protein  58.41 
 
 		 318 aa  363  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  58.01 
 
 		 320 aa  363  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  57.32 
 
 		 323 aa  363  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  58.01 
 
 		 319 aa  363  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  56.65 
 
 		 317 aa  361  7.0000000000000005e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  56.51 
 
 		 320 aa  360  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  58.01 
 
 		 320 aa  360  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  56.19 
 
 		 320 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  56.19 
 
 		 320 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3045  thioredoxin-disulfide reductase  56.19 
 
 		 320 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  56.19 
 
 		 320 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  56.19 
 
 		 320 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  57.69 
 
 		 320 aa  360  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2621  thioredoxin-disulfide reductase  56.19 
 
 		 320 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105399  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2208  thioredoxin reductase  60.26 
 
 		 338 aa  360  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1991  thioredoxin-disulfide reductase  56.19 
 
 		 320 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  58.65 
 
 		 316 aa  359  3e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  58.65 
 
 		 316 aa  360  3e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  55.94 
 
 		 317 aa  359  3e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  56.47 
 
 		 318 aa  359  4e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2153  thioredoxin reductase  57.32 
 
 		 318 aa  359  5e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.969122  normal  0.900366 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  57.32 
 
 		 319 aa  358  5e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  55.77 
 
 		 316 aa  358  6e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  56.78 
 
 		 319 aa  358  6e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0388  putative thioredoxin reductase  53.68 
 
 		 340 aa  358  7e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.457738  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  55.77 
 
 		 316 aa  358  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  56.41 
 
 		 314 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0684  thioredoxin reductase  56.43 
 
 		 317 aa  357  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00860267  normal  0.703249 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4032  thioredoxin reductase  56.96 
 
 		 316 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000634849  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2557  thioredoxin reductase  57.01 
 
 		 318 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06129  thioredoxin-disulfide reductase  56.52 
 
 		 322 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  58.01 
 
 		 316 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000407332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01037  thioredoxin-disulfide reductase  56.52 
 
 		 322 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.088167  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1037  thioredoxin reductase  57.46 
 
 		 333 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.526099 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  57.37 
 
 		 319 aa  355  3.9999999999999996e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  58.79 
 
 		 321 aa  355  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1283  thioredoxin reductase  54.52 
 
 		 319 aa  356  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1072  thioredoxin reductase  58.79 
 
 		 322 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00976208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  55.06 
 
 		 319 aa  355  5e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0429  thioredoxin reductase  53.37 
 
 		 340 aa  355  5e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.749384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  58.79 
 
 		 322 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  57.14 
 
 		 333 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0023  thioredoxin reductase  54.11 
 
 		 316 aa  354  1e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1932  thioredoxin reductase  54.63 
 
 		 323 aa  354  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>