More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2557 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2557  thioredoxin reductase  100 
 
 		 318 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2153  thioredoxin reductase  99.06 
 
 		 318 aa  649    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.969122  normal  0.900366 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2342  thioredoxin reductase oxidoreductase protein  87.74 
 
 		 318 aa  586  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0684  thioredoxin reductase  80.44 
 
 		 317 aa  537  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00860267  normal  0.703249 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  79.05 
 
 		 320 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  79.05 
 
 		 320 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  78.41 
 
 		 320 aa  522  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3045  thioredoxin-disulfide reductase  79.05 
 
 		 320 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  79.05 
 
 		 320 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  79.05 
 
 		 320 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  79.37 
 
 		 320 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  79.11 
 
 		 333 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1037  thioredoxin reductase  79.11 
 
 		 333 aa  521  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.526099 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2621  thioredoxin-disulfide reductase  79.05 
 
 		 320 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105399  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1991  thioredoxin-disulfide reductase  79.05 
 
 		 320 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2601  thioredoxin reductase  76.54 
 
 		 321 aa  519  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  77.78 
 
 		 346 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  77.78 
 
 		 320 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  77.78 
 
 		 346 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  77.78 
 
 		 320 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1162  thioredoxin reductase  78.16 
 
 		 318 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.238547 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  77.78 
 
 		 320 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  77.78 
 
 		 320 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0689  thioredoxin reductase  77.78 
 
 		 318 aa  512  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.200381  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0634  thioredoxin reductase  77.78 
 
 		 333 aa  511  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5364  thioredoxin reductase  74.76 
 
 		 337 aa  504  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1119  thioredoxin reductase  76.51 
 
 		 316 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.202817  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  74.6 
 
 		 317 aa  498  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3383  thioredoxin reductase  74.68 
 
 		 317 aa  495  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  74.68 
 
 		 317 aa  496  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1118  thioredoxin reductase  74.36 
 
 		 316 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1758  thioredoxin reductase  73.16 
 
 		 326 aa  493  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.852508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  73.48 
 
 		 352 aa  491  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0023  thioredoxin reductase  72.78 
 
 		 316 aa  490  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3213  thioredoxin reductase  74.12 
 
 		 314 aa  488  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.166551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3179  thioredoxin reductase  74.36 
 
 		 316 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3801  thioredoxin reductase  73.16 
 
 		 328 aa  487  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3427  thioredoxin reductase  73.16 
 
 		 319 aa  487  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116946  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1283  thioredoxin reductase  73.16 
 
 		 319 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  71.25 
 
 		 317 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  70.25 
 
 		 323 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  70.57 
 
 		 320 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  70.57 
 
 		 320 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  70.57 
 
 		 320 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  71.43 
 
 		 319 aa  464  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  71.75 
 
 		 319 aa  467  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  68.89 
 
 		 320 aa  461  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  68.57 
 
 		 319 aa  462  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1001  thioredoxin reductase  69.52 
 
 		 345 aa  463  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.24844  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  71.11 
 
 		 319 aa  464  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  71.66 
 
 		 318 aa  462  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0754  thioredoxin reductase  72.52 
 
 		 321 aa  463  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  69.09 
 
 		 316 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  68.25 
 
 		 320 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4032  thioredoxin reductase  68.25 
 
 		 316 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000634849  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  68.57 
 
 		 321 aa  455  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  68.67 
 
 		 319 aa  457  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  68.25 
 
 		 320 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  68.35 
 
 		 321 aa  454  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  68.25 
 
 		 320 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  68.25 
 
 		 320 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  69.75 
 
 		 317 aa  454  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  69.21 
 
 		 317 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00892  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  68.25 
 
 		 321 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  68.25 
 
 		 321 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  67.94 
 
 		 317 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  68.89 
 
 		 320 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  68.25 
 
 		 320 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0887  thioredoxin reductase  67.72 
 
 		 320 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  68.25 
 
 		 321 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1050  thioredoxin reductase  68.25 
 
 		 321 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000235297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  68.25 
 
 		 321 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  68.25 
 
 		 321 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1412  thioredoxin reductase  68.35 
 
 		 322 aa  453  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00718409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2441  thioredoxin reductase  68.25 
 
 		 321 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000126981  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  68.25 
 
 		 321 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2389  thioredoxin reductase  66.88 
 
 		 316 aa  447  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0722352 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2762  thioredoxin-disulfide reductase  68.89 
 
 		 315 aa  450  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117857  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  67.94 
 
 		 320 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  67.82 
 
 		 319 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  67.62 
 
 		 322 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1023  thioredoxin reductase  67.62 
 
 		 322 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00170984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  68.15 
 
 		 316 aa  448  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000407332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1057  thioredoxin reductase  67.62 
 
 		 322 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00951777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  68.79 
 
 		 314 aa  450  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0963  thioredoxin reductase  67.62 
 
 		 322 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000679645  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1072  thioredoxin reductase  67.62 
 
 		 322 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00976208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  68.05 
 
 		 316 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  68.57 
 
 		 320 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  68.77 
 
 		 318 aa  447  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  67.09 
 
 		 317 aa  450  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  66.88 
 
 		 317 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  68.05 
 
 		 316 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2959  thioredoxin reductase  68.67 
 
 		 317 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.457436  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  66.98 
 
 		 318 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  67.3 
 
 		 316 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0978  thioredoxin reductase  67.94 
 
 		 315 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.993828  normal  0.0140705 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  65.71 
 
 		 320 aa  442  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  65.71 
 
 		 320 aa  442  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2124  thioredoxin reductase  66.98 
 
 		 316 aa  443  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000128654  normal  0.0108632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>