More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5827 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  100 
 
 		 325 aa  665    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  94.77 
 
 		 325 aa  642    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  84 
 
 		 324 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0563  thioredoxin reductase  87.04 
 
 		 326 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0552475  normal  0.0148693 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  83.08 
 
 		 324 aa  570  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  83.08 
 
 		 324 aa  569  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  71.08 
 
 		 326 aa  483  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  68.94 
 
 		 326 aa  472  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  69.28 
 
 		 321 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  69.93 
 
 		 321 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  68.5 
 
 		 324 aa  467  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  71.24 
 
 		 321 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  71.34 
 
 		 321 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  68.94 
 
 		 321 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  70.68 
 
 		 334 aa  454  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  68.63 
 
 		 321 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  68.39 
 
 		 321 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  72.08 
 
 		 314 aa  448  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  65.55 
 
 		 324 aa  444  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  69.48 
 
 		 345 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  63.19 
 
 		 338 aa  438  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  66.56 
 
 		 320 aa  438  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  64.33 
 
 		 324 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  64.33 
 
 		 324 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_004310  BR1499  thioredoxin reductase  64.94 
 
 		 324 aa  428  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.770592  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  67.1 
 
 		 317 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1664  thioredoxin reductase  65.55 
 
 		 324 aa  427  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28715  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  67.1 
 
 		 312 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  67.53 
 
 		 335 aa  423  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  66.23 
 
 		 335 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  63.06 
 
 		 331 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  64.84 
 
 		 321 aa  420  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0981  thioredoxin-disulfide reductase  62.94 
 
 		 317 aa  413  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.708131  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  63.99 
 
 		 314 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  62.1 
 
 		 322 aa  407  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  60.9 
 
 		 323 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  61.95 
 
 		 332 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  61.56 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1450  thioredoxin-disulfide reductase  64.63 
 
 		 324 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  61.24 
 
 		 313 aa  395  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  60.26 
 
 		 314 aa  393  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  59.5 
 
 		 316 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  58.88 
 
 		 316 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2208  thioredoxin reductase  62.62 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  57.81 
 
 		 319 aa  378  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2959  thioredoxin reductase  62.38 
 
 		 317 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.457436  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  58.79 
 
 		 317 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  58.23 
 
 		 320 aa  374  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  58.23 
 
 		 320 aa  374  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  59.38 
 
 		 316 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  57.59 
 
 		 314 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  59.75 
 
 		 318 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  59.06 
 
 		 316 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  58.71 
 
 		 323 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0388  putative thioredoxin reductase  56.56 
 
 		 340 aa  368  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.457738  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  58.71 
 
 		 323 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4032  thioredoxin reductase  57.19 
 
 		 316 aa  368  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000634849  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  55.97 
 
 		 342 aa  370  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  58.15 
 
 		 317 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  56.65 
 
 		 317 aa  365  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  58.15 
 
 		 352 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  57.68 
 
 		 316 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000407332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  58.17 
 
 		 314 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  58.17 
 
 		 314 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0429  thioredoxin reductase  55.56 
 
 		 340 aa  365  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.749384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  58.49 
 
 		 319 aa  368  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  57.81 
 
 		 316 aa  364  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00892  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  59.12 
 
 		 321 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  59.12 
 
 		 321 aa  363  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  59.12 
 
 		 321 aa  363  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  59.12 
 
 		 321 aa  363  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  59.43 
 
 		 321 aa  363  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  59.12 
 
 		 321 aa  363  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  59.12 
 
 		 321 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1050  thioredoxin reductase  59.12 
 
 		 321 aa  363  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000235297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  57.73 
 
 		 316 aa  362  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  59.12 
 
 		 322 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  59.06 
 
 		 320 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1072  thioredoxin reductase  59.12 
 
 		 322 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00976208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  57.91 
 
 		 318 aa  362  6e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0978  thioredoxin reductase  60.13 
 
 		 315 aa  362  6e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.993828  normal  0.0140705 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  57.73 
 
 		 316 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  55.25 
 
 		 321 aa  361  8e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2441  thioredoxin reductase  58.81 
 
 		 321 aa  361  9e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000126981  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2389  thioredoxin reductase  56.47 
 
 		 316 aa  361  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0722352 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  57.14 
 
 		 320 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  57.14 
 
 		 320 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  57.14 
 
 		 320 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  55.73 
 
 		 320 aa  360  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0963  thioredoxin reductase  58.81 
 
 		 322 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000679645  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  57.37 
 
 		 319 aa  360  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1057  thioredoxin reductase  58.81 
 
 		 322 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00951777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  57.68 
 
 		 319 aa  360  2e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  56.83 
 
 		 346 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1023  thioredoxin reductase  58.81 
 
 		 322 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00170984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  56.83 
 
 		 320 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  56.04 
 
 		 320 aa  360  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  58.93 
 
 		 320 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  58.93 
 
 		 320 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  58.93 
 
 		 320 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>