More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2991 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2621  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
320 aa  658    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105399  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
320 aa  658    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
320 aa  658    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1991  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
320 aa  658    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
320 aa  658    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
320 aa  658    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  97.5 
 
 
320 aa  644    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3045  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
320 aa  658    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  91.25 
 
 
320 aa  614  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  90 
 
 
346 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  89.06 
 
 
320 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  89.06 
 
 
320 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  89.06 
 
 
320 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  88.44 
 
 
346 aa  597  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  88.44 
 
 
320 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0634  thioredoxin reductase  87.7 
 
 
333 aa  586  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  85.17 
 
 
333 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1037  thioredoxin reductase  83.91 
 
 
333 aa  565  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.526099 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0684  thioredoxin reductase  80 
 
 
317 aa  539  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00860267  normal  0.703249 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2601  thioredoxin reductase  79.56 
 
 
321 aa  530  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0689  thioredoxin reductase  81.27 
 
 
318 aa  533  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.200381  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1162  thioredoxin reductase  80.63 
 
 
318 aa  530  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.238547 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2342  thioredoxin reductase oxidoreductase protein  79.94 
 
 
318 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2153  thioredoxin reductase  79.68 
 
 
318 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.969122  normal  0.900366 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2557  thioredoxin reductase  79.05 
 
 
318 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1119  thioredoxin reductase  76.92 
 
 
316 aa  513  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.202817  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  75.48 
 
 
317 aa  510  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  75.8 
 
 
317 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1118  thioredoxin reductase  75.48 
 
 
316 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0023  thioredoxin reductase  73.25 
 
 
316 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3383  thioredoxin reductase  75.8 
 
 
317 aa  504  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3179  thioredoxin reductase  76.11 
 
 
316 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1283  thioredoxin reductase  75.8 
 
 
319 aa  505  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  73.95 
 
 
352 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3427  thioredoxin reductase  75.16 
 
 
319 aa  502  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116946  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3213  thioredoxin reductase  75.81 
 
 
314 aa  498  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.166551  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1758  thioredoxin reductase  72.67 
 
 
326 aa  498  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.852508  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5364  thioredoxin reductase  74.92 
 
 
337 aa  498  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  73.57 
 
 
317 aa  494  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3801  thioredoxin reductase  75.32 
 
 
328 aa  496  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  72.01 
 
 
319 aa  488  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  73.08 
 
 
320 aa  484  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  72.64 
 
 
319 aa  485  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  72.64 
 
 
319 aa  482  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1001  thioredoxin reductase  71.56 
 
 
345 aa  482  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.24844  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  70.66 
 
 
319 aa  483  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  70.57 
 
 
317 aa  479  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0754  thioredoxin reductase  74.44 
 
 
321 aa  475  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  72.35 
 
 
316 aa  471  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4032  thioredoxin reductase  70.74 
 
 
316 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000634849  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  69.4 
 
 
323 aa  464  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  71.38 
 
 
316 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000407332  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  69.84 
 
 
318 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  68.75 
 
 
320 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  68.75 
 
 
320 aa  464  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  68.35 
 
 
316 aa  462  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  68.75 
 
 
320 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  69.11 
 
 
317 aa  461  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  68.44 
 
 
320 aa  458  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  68.47 
 
 
316 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  68.47 
 
 
316 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2762  thioredoxin-disulfide reductase  69.3 
 
 
315 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117857  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0388  putative thioredoxin reductase  65.71 
 
 
340 aa  455  1e-127  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.457738  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  66.67 
 
 
320 aa  457  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  67.19 
 
 
319 aa  455  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1713  thioredoxin reductase  68.89 
 
 
317 aa  455  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000742143  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2959  thioredoxin reductase  68.45 
 
 
317 aa  455  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.457436  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0429  thioredoxin reductase  65.71 
 
 
340 aa  456  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.749384  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  66.67 
 
 
320 aa  457  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  69.18 
 
 
319 aa  457  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  69.62 
 
 
318 aa  455  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  67.72 
 
 
321 aa  456  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  68.14 
 
 
317 aa  457  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  66.98 
 
 
317 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2389  thioredoxin reductase  66.03 
 
 
316 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0722352 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  67.6 
 
 
321 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  67.3 
 
 
314 aa  451  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28230  thioredoxin-disulfide reductase  69.43 
 
 
315 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.75824  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2017  thioredoxin reductase  66.98 
 
 
317 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000213161  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  66.98 
 
 
317 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000827938  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  67.5 
 
 
320 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  66.67 
 
 
342 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00892  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  67.29 
 
 
321 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  67.29 
 
 
321 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  67.09 
 
 
320 aa  447  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  67.29 
 
 
321 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  67.6 
 
 
323 aa  448  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  67.6 
 
 
323 aa  448  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  67.09 
 
 
320 aa  447  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  67.09 
 
 
320 aa  447  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  67.29 
 
 
321 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2218  thioredoxin reductase  66.67 
 
 
317 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123307  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  67.29 
 
 
321 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  67.85 
 
 
316 aa  447  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  67.29 
 
 
321 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2188  thioredoxin reductase  66.67 
 
 
317 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000784195  normal  0.0220787 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1959  thioredoxin reductase  66.67 
 
 
317 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000155114  normal  0.552411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2028  thioredoxin reductase  66.98 
 
 
316 aa  449  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102058  hitchhiker  0.0000262597 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2152  thioredoxin reductase  66.67 
 
 
317 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485942  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1050  thioredoxin reductase  67.29 
 
 
321 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000235297  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>