More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1293 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  100 
 
 		 320 aa  664    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1119  thioredoxin reductase  77.88 
 
 		 316 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.202817  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  75.72 
 
 		 317 aa  509  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  74.19 
 
 		 317 aa  500  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0023  thioredoxin reductase  74.36 
 
 		 316 aa  497  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  71.88 
 
 		 352 aa  491  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  73.08 
 
 		 320 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  73.08 
 
 		 346 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2601  thioredoxin reductase  72.33 
 
 		 321 aa  490  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1001  thioredoxin reductase  72.38 
 
 		 345 aa  489  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.24844  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  72.01 
 
 		 333 aa  488  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  72.76 
 
 		 320 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  72.76 
 
 		 320 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  72.76 
 
 		 320 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3045  thioredoxin-disulfide reductase  73.08 
 
 		 320 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  73.08 
 
 		 320 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1991  thioredoxin-disulfide reductase  73.08 
 
 		 320 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  73.08 
 
 		 320 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0634  thioredoxin reductase  71.38 
 
 		 333 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  73.08 
 
 		 320 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  72.44 
 
 		 346 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  72.12 
 
 		 320 aa  484  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  71.15 
 
 		 319 aa  484  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2621  thioredoxin-disulfide reductase  73.08 
 
 		 320 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4032  thioredoxin reductase  72.29 
 
 		 316 aa  486  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000634849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  73.08 
 
 		 320 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  72.12 
 
 		 320 aa  481  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0684  thioredoxin reductase  70.48 
 
 		 317 aa  481  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00860267  normal  0.703249 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1037  thioredoxin reductase  70.75 
 
 		 333 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.526099 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  72.35 
 
 		 316 aa  475  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  69.97 
 
 		 317 aa  477  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2342  thioredoxin reductase oxidoreductase protein  71.02 
 
 		 318 aa  473  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  71.97 
 
 		 318 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1758  thioredoxin reductase  69.45 
 
 		 326 aa  468  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.852508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0689  thioredoxin reductase  71.15 
 
 		 318 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.200381  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  70.06 
 
 		 319 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  69.33 
 
 		 314 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  69.09 
 
 		 319 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  70.51 
 
 		 316 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  70.51 
 
 		 316 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1118  thioredoxin reductase  69.03 
 
 		 316 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  71.2 
 
 		 320 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0887  thioredoxin reductase  71.75 
 
 		 320 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  71.2 
 
 		 320 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  71.38 
 
 		 316 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000407332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2153  thioredoxin reductase  69.52 
 
 		 318 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.969122  normal  0.900366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  71.2 
 
 		 320 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  71.2 
 
 		 320 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  69.09 
 
 		 316 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1162  thioredoxin reductase  70.51 
 
 		 318 aa  464  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.238547 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  69.45 
 
 		 317 aa  463  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3383  thioredoxin reductase  69.45 
 
 		 317 aa  462  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  67.3 
 
 		 342 aa  461  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0791  thioredoxin reductase  66.56 
 
 		 321 aa  461  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2557  thioredoxin reductase  68.89 
 
 		 318 aa  461  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0703  thioredoxin reductase  66.56 
 
 		 321 aa  461  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3213  thioredoxin reductase  68.91 
 
 		 314 aa  461  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.166551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1982  thioredoxin reductase  67.63 
 
 		 328 aa  459  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.343784  normal  0.438815 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  69.59 
 
 		 323 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  69.5 
 
 		 320 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  70.16 
 
 		 320 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2289  thioredoxin reductase  66.25 
 
 		 320 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5364  thioredoxin reductase  67.2 
 
 		 337 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3179  thioredoxin reductase  68.39 
 
 		 316 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1283  thioredoxin reductase  68.05 
 
 		 319 aa  460  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2389  thioredoxin reductase  67.63 
 
 		 316 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0722352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  69.59 
 
 		 323 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3427  thioredoxin reductase  69.01 
 
 		 319 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116946  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1932  thioredoxin reductase  66.67 
 
 		 323 aa  455  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  67.94 
 
 		 318 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0388  putative thioredoxin reductase  66.67 
 
 		 340 aa  454  1e-127  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.457738  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28230  thioredoxin-disulfide reductase  69.65 
 
 		 315 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.75824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  69.33 
 
 		 316 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1360  thioredoxin reductase  67.42 
 
 		 332 aa  454  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  67.31 
 
 		 316 aa  455  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2028  thioredoxin reductase  69.35 
 
 		 316 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102058  hitchhiker  0.0000262597 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  68.37 
 
 		 320 aa  455  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  68.69 
 
 		 317 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01037  thioredoxin-disulfide reductase  65.92 
 
 		 322 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.088167  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  66.88 
 
 		 316 aa  451  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06129  thioredoxin-disulfide reductase  65.92 
 
 		 322 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345376  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  67.83 
 
 		 319 aa  451  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  68.27 
 
 		 320 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3801  thioredoxin reductase  67.09 
 
 		 328 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  66.77 
 
 		 320 aa  454  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  67.41 
 
 		 323 aa  453  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  68.27 
 
 		 320 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  68.69 
 
 		 316 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  66.77 
 
 		 320 aa  454  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  68.27 
 
 		 320 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  67.82 
 
 		 316 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  68.39 
 
 		 317 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  66.98 
 
 		 319 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2762  thioredoxin-disulfide reductase  66.88 
 
 		 315 aa  449  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117857  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  68.49 
 
 		 317 aa  448  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  66.56 
 
 		 316 aa  449  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2959  thioredoxin reductase  67.2 
 
 		 317 aa  449  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.457436  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0978  thioredoxin reductase  68.69 
 
 		 315 aa  448  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.993828  normal  0.0140705 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  66.99 
 
 		 317 aa  449  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  67.41 
 
 		 320 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>