More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1611 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  100 
 
 
320 aa  660    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
320 aa  660    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  100 
 
 
320 aa  660    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  88.99 
 
 
323 aa  590  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  86.88 
 
 
320 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  86.56 
 
 
320 aa  580  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  87.07 
 
 
318 aa  577  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  86.56 
 
 
319 aa  574  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00892  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  85.05 
 
 
321 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  85.05 
 
 
321 aa  569  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  85.05 
 
 
321 aa  569  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  85.05 
 
 
321 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  85.05 
 
 
321 aa  569  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1050  thioredoxin reductase  85.05 
 
 
321 aa  569  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000235297  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  85.05 
 
 
321 aa  569  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1412  thioredoxin reductase  85.85 
 
 
322 aa  568  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00718409  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  85.05 
 
 
321 aa  569  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1023  thioredoxin reductase  84.64 
 
 
322 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00170984  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1057  thioredoxin reductase  84.64 
 
 
322 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00951777  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1072  thioredoxin reductase  84.64 
 
 
322 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00976208  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2441  thioredoxin reductase  84.74 
 
 
321 aa  567  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000126981  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0963  thioredoxin reductase  84.64 
 
 
322 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000679645  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  84.64 
 
 
322 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  84.71 
 
 
318 aa  558  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  82.8 
 
 
317 aa  548  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  82.17 
 
 
317 aa  544  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1959  thioredoxin reductase  82.17 
 
 
317 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000155114  normal  0.552411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2017  thioredoxin reductase  82.17 
 
 
317 aa  544  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000213161  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  82.17 
 
 
317 aa  544  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000827938  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  81.33 
 
 
321 aa  545  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  80.19 
 
 
319 aa  540  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2188  thioredoxin reductase  80.57 
 
 
317 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000784195  normal  0.0220787 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  79.25 
 
 
319 aa  536  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2152  thioredoxin reductase  80.57 
 
 
317 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485942  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2326  thioredoxin reductase  80.57 
 
 
317 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000028573  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2014  thioredoxin reductase  80.57 
 
 
317 aa  536  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000856982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2218  thioredoxin reductase  80.57 
 
 
317 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123307  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2028  thioredoxin reductase  80.57 
 
 
316 aa  533  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102058  hitchhiker  0.0000262597 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2762  thioredoxin-disulfide reductase  79.75 
 
 
315 aa  530  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117857  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1713  thioredoxin reductase  80.57 
 
 
317 aa  528  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000742143  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2486  thioredoxin reductase  79.3 
 
 
318 aa  524  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000100803  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2124  thioredoxin reductase  78.34 
 
 
316 aa  522  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000128654  normal  0.0108632 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2258  thioredoxin reductase  78.66 
 
 
316 aa  523  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000669147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  76.58 
 
 
316 aa  517  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1932  thioredoxin reductase  78.34 
 
 
317 aa  520  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520435  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  76.75 
 
 
317 aa  516  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2209  thioredoxin reductase  77.53 
 
 
316 aa  511  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.247616 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  75.32 
 
 
319 aa  508  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  74.53 
 
 
319 aa  505  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01640  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding protein  77.7 
 
 
310 aa  504  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00689976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  75.79 
 
 
320 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  75.47 
 
 
320 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  76.11 
 
 
316 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  76.11 
 
 
316 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2389  thioredoxin reductase  75.16 
 
 
316 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0722352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  73.27 
 
 
320 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  73.27 
 
 
320 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  73.89 
 
 
317 aa  492  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  73.27 
 
 
320 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  73.27 
 
 
320 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0887  thioredoxin reductase  72.96 
 
 
320 aa  484  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1119  thioredoxin reductase  73.16 
 
 
316 aa  486  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.202817  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  72.26 
 
 
352 aa  487  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  71.84 
 
 
319 aa  486  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28230  thioredoxin-disulfide reductase  75.48 
 
 
315 aa  482  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.75824  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  72.93 
 
 
317 aa  482  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3383  thioredoxin reductase  72.93 
 
 
317 aa  481  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  72.29 
 
 
316 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0023  thioredoxin reductase  71.97 
 
 
316 aa  480  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  72.29 
 
 
316 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  71.97 
 
 
317 aa  480  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0978  thioredoxin reductase  71.84 
 
 
315 aa  475  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.993828  normal  0.0140705 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  71.66 
 
 
317 aa  477  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3179  thioredoxin reductase  71.02 
 
 
316 aa  475  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  69.62 
 
 
316 aa  471  1e-132  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2601  thioredoxin reductase  69.28 
 
 
321 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2959  thioredoxin reductase  72.15 
 
 
317 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.457436  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0684  thioredoxin reductase  70.16 
 
 
317 aa  471  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00860267  normal  0.703249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3427  thioredoxin reductase  70.38 
 
 
319 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116946  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  68.99 
 
 
317 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  69.62 
 
 
316 aa  470  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1001  thioredoxin reductase  70.94 
 
 
345 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.24844  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0046  thioredoxin reductase  72.38 
 
 
319 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  68.44 
 
 
320 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2153  thioredoxin reductase  71.2 
 
 
318 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.969122  normal  0.900366 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  69.38 
 
 
320 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0429  thioredoxin reductase  69.87 
 
 
340 aa  468  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.749384  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0321  thioredoxin-disulfide reductase  69.84 
 
 
319 aa  469  1.0000000000000001e-131  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.101036  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  69.06 
 
 
320 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  69.06 
 
 
320 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  68.44 
 
 
346 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  69.06 
 
 
320 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2289  thioredoxin reductase  68.89 
 
 
320 aa  464  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  70.25 
 
 
318 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0388  putative thioredoxin reductase  69.55 
 
 
340 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.457738  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01037  thioredoxin-disulfide reductase  69.97 
 
 
322 aa  464  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.088167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06129  thioredoxin-disulfide reductase  69.97 
 
 
322 aa  464  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345376  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  69.06 
 
 
320 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2557  thioredoxin reductase  70.57 
 
 
318 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3801  thioredoxin reductase  70.83 
 
 
328 aa  464  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>