More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3838 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  100 
 
 		 321 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  89.35 
 
 		 321 aa  580  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  87.42 
 
 		 321 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  88.47 
 
 		 321 aa  573  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  87.23 
 
 		 321 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  85.81 
 
 		 321 aa  567  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  86.6 
 
 		 321 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  68.85 
 
 		 325 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  76.39 
 
 		 320 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  70.35 
 
 		 334 aa  468  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  66.77 
 
 		 326 aa  463  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  71.34 
 
 		 325 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  67.97 
 
 		 324 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  66.35 
 
 		 326 aa  460  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  67.97 
 
 		 324 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  67.32 
 
 		 324 aa  455  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  67.19 
 
 		 324 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  71.2 
 
 		 335 aa  454  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  66.56 
 
 		 324 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  66.88 
 
 		 324 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  69.87 
 
 		 314 aa  450  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  65.62 
 
 		 338 aa  444  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0563  thioredoxin reductase  69.06 
 
 		 326 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0552475  normal  0.0148693 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  67.19 
 
 		 345 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  67.41 
 
 		 317 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  67.41 
 
 		 312 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  65.62 
 
 		 324 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  65.92 
 
 		 331 aa  441  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  66.67 
 
 		 335 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  66.56 
 
 		 332 aa  431  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  66.56 
 
 		 313 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  64.71 
 
 		 321 aa  432  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  67.11 
 
 		 314 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  62.7 
 
 		 322 aa  414  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1664  thioredoxin reductase  64.69 
 
 		 324 aa  415  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28715  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1499  thioredoxin reductase  64.06 
 
 		 324 aa  412  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.770592  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2208  thioredoxin reductase  68.18 
 
 		 338 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0981  thioredoxin-disulfide reductase  62.46 
 
 		 317 aa  408  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.708131  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  60.19 
 
 		 323 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  62.99 
 
 		 361 aa  401  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  59.24 
 
 		 314 aa  396  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1450  thioredoxin-disulfide reductase  63.75 
 
 		 324 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0331  thioredoxin reductase  59.49 
 
 		 321 aa  376  1e-103  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0735  thioredoxin-disulfide reductase  58.23 
 
 		 318 aa  374  1e-102  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  57.88 
 
 		 314 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  57.88 
 
 		 314 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  56.78 
 
 		 317 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  56.47 
 
 		 314 aa  362  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  55.84 
 
 		 317 aa  361  8e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0558  thioredoxin-disulfide reductase  56.27 
 
 		 314 aa  361  9e-99  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  57.62 
 
 		 311 aa  360  1e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  57.37 
 
 		 323 aa  360  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  54.57 
 
 		 316 aa  360  2e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  57.95 
 
 		 311 aa  360  2e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  57.37 
 
 		 323 aa  360  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  55.52 
 
 		 317 aa  360  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  54.26 
 
 		 316 aa  359  3e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  57.28 
 
 		 311 aa  359  3e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  55.63 
 
 		 311 aa  357  9.999999999999999e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  55.21 
 
 		 319 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  56.91 
 
 		 311 aa  355  5e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  56.43 
 
 		 319 aa  355  5.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  54.26 
 
 		 320 aa  353  2e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  56.35 
 
 		 320 aa  353  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  54.26 
 
 		 320 aa  353  2e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  56.47 
 
 		 320 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  56.47 
 
 		 320 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3045  thioredoxin-disulfide reductase  56.47 
 
 		 320 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  56.47 
 
 		 320 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  56.47 
 
 		 320 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  56.47 
 
 		 320 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1991  thioredoxin-disulfide reductase  56.47 
 
 		 320 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2621  thioredoxin-disulfide reductase  56.47 
 
 		 320 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  55.84 
 
 		 320 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  55.84 
 
 		 320 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  55.84 
 
 		 320 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  55.84 
 
 		 320 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  55.84 
 
 		 346 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2028  thioredoxin reductase  54.23 
 
 		 316 aa  352  7e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102058  hitchhiker  0.0000262597 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  58.2 
 
 		 314 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  55.21 
 
 		 318 aa  350  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  55.84 
 
 		 319 aa  350  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  55.84 
 
 		 320 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2959  thioredoxin reductase  57.1 
 
 		 317 aa  350  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.457436  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  55.52 
 
 		 346 aa  348  9e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  56.09 
 
 		 320 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  53.61 
 
 		 317 aa  347  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  53.61 
 
 		 317 aa  347  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000827938  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  57.56 
 
 		 314 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1713  thioredoxin reductase  53.92 
 
 		 317 aa  347  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000742143  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1959  thioredoxin reductase  53.29 
 
 		 317 aa  346  3e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000155114  normal  0.552411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2017  thioredoxin reductase  53.63 
 
 		 317 aa  346  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000213161  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2389  thioredoxin reductase  54.26 
 
 		 316 aa  346  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0722352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  54.91 
 
 		 323 aa  345  4e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  55.21 
 
 		 320 aa  345  5e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  54.4 
 
 		 334 aa  345  5e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  53.92 
 
 		 321 aa  345  5e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  55.52 
 
 		 319 aa  345  5e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  56.78 
 
 		 320 aa  345  6e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  54.55 
 
 		 319 aa  345  7e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>