More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1544 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  100 
 
 		 311 aa  642    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  84.57 
 
 		 311 aa  558  1e-158  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  82.64 
 
 		 311 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  80.71 
 
 		 311 aa  532  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  79.1 
 
 		 311 aa  525  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  72.03 
 
 		 311 aa  494  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  73.63 
 
 		 311 aa  494  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  62.33 
 
 		 314 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  62.33 
 
 		 314 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  62.33 
 
 		 314 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  61.39 
 
 		 319 aa  385  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  59.67 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  62 
 
 		 314 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  60.52 
 
 		 325 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  54.95 
 
 		 361 aa  361  9e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  56.72 
 
 		 348 aa  359  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  56.29 
 
 		 321 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  55.19 
 
 		 317 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  55.19 
 
 		 312 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  57.52 
 
 		 310 aa  353  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  56.29 
 
 		 321 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  55.99 
 
 		 314 aa  352  4e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  56.54 
 
 		 319 aa  351  8e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  56.35 
 
 		 332 aa  351  8.999999999999999e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  59.47 
 
 		 335 aa  351  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  55.08 
 
 		 331 aa  351  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  56.45 
 
 		 311 aa  350  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  54.55 
 
 		 314 aa  350  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  56.13 
 
 		 320 aa  350  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  54.22 
 
 		 318 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  53.23 
 
 		 314 aa  348  7e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  55.3 
 
 		 321 aa  348  9e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  57.62 
 
 		 321 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  59.08 
 
 		 325 aa  346  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  55.19 
 
 		 320 aa  346  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  55.19 
 
 		 320 aa  346  3e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  55.19 
 
 		 320 aa  346  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  51.46 
 
 		 331 aa  346  3e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  54.55 
 
 		 310 aa  346  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  54.1 
 
 		 324 aa  345  6e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  54.3 
 
 		 345 aa  345  7e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  51.28 
 
 		 320 aa  344  8.999999999999999e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  51.28 
 
 		 320 aa  344  8.999999999999999e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  57.1 
 
 		 321 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  53.99 
 
 		 324 aa  344  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  53.85 
 
 		 458 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  52.08 
 
 		 325 aa  343  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  52.84 
 
 		 327 aa  343  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  52.26 
 
 		 335 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  56.77 
 
 		 321 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  53.38 
 
 		 317 aa  342  5e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  54.84 
 
 		 320 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  51.25 
 
 		 316 aa  341  8e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  51.57 
 
 		 316 aa  340  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  56.03 
 
 		 348 aa  341  1e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  53.11 
 
 		 324 aa  341  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  53.44 
 
 		 324 aa  341  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  54.72 
 
 		 330 aa  341  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  53.92 
 
 		 310 aa  340  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  53.04 
 
 		 324 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  55.96 
 
 		 321 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  52.72 
 
 		 338 aa  339  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  55.31 
 
 		 333 aa  339  5e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  53.04 
 
 		 324 aa  338  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  50.79 
 
 		 316 aa  338  7e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  50.79 
 
 		 316 aa  338  7e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  53.42 
 
 		 326 aa  338  7e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  55.59 
 
 		 331 aa  338  8e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  55.56 
 
 		 310 aa  338  9e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  54.4 
 
 		 330 aa  337  9.999999999999999e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  53.97 
 
 		 326 aa  338  9.999999999999999e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  53.25 
 
 		 313 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  52.4 
 
 		 313 aa  337  1.9999999999999998e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  53.85 
 
 		 322 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  51.13 
 
 		 319 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  53.72 
 
 		 314 aa  336  2.9999999999999997e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  56.69 
 
 		 317 aa  335  5e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  52.65 
 
 		 313 aa  335  5e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  53.23 
 
 		 313 aa  335  5.999999999999999e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  55.19 
 
 		 333 aa  335  7e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  55.19 
 
 		 333 aa  335  7e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  54.84 
 
 		 314 aa  335  7e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  55.19 
 
 		 333 aa  335  7e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  53.04 
 
 		 361 aa  335  7.999999999999999e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  50.95 
 
 		 316 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  51.75 
 
 		 323 aa  334  9e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  51.74 
 
 		 316 aa  334  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000407332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  56.69 
 
 		 362 aa  333  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  52.13 
 
 		 323 aa  333  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  52.13 
 
 		 323 aa  333  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  52.16 
 
 		 322 aa  333  3e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  55.56 
 
 		 334 aa  333  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0563  thioredoxin reductase  53.92 
 
 		 326 aa  332  4e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0552475  normal  0.0148693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  54.25 
 
 		 325 aa  332  6e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  51.1 
 
 		 320 aa  332  7.000000000000001e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  54.05 
 
 		 460 aa  332  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  52.09 
 
 		 319 aa  332  7.000000000000001e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  52.26 
 
 		 319 aa  331  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  51.11 
 
 		 317 aa  330  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3328  thioredoxin reductase  50.78 
 
 		 318 aa  331  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>