More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2943 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  100 
 
 		 333 aa  689    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  57.19 
 
 		 314 aa  359  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  57.19 
 
 		 314 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  55.31 
 
 		 311 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  54.34 
 
 		 311 aa  348  7e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  56.48 
 
 		 319 aa  345  6e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  53.77 
 
 		 311 aa  345  6e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  53.25 
 
 		 311 aa  345  8.999999999999999e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  54.19 
 
 		 310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  56.62 
 
 		 325 aa  342  5e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  53.75 
 
 		 311 aa  342  7e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  54.05 
 
 		 334 aa  341  9e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  54.02 
 
 		 311 aa  341  1e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  54.43 
 
 		 319 aa  340  1e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  56.86 
 
 		 314 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  53.75 
 
 		 311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  52.98 
 
 		 348 aa  339  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  52.22 
 
 		 320 aa  337  9.999999999999999e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  52.22 
 
 		 320 aa  337  9.999999999999999e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  54.02 
 
 		 311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  56.52 
 
 		 314 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  51.29 
 
 		 316 aa  335  5.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  51.62 
 
 		 310 aa  335  7e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  54.1 
 
 		 310 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  55.95 
 
 		 330 aa  333  3e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  55.81 
 
 		 348 aa  332  6e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  52.56 
 
 		 320 aa  331  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  51.32 
 
 		 323 aa  330  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  51.32 
 
 		 323 aa  330  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  52.87 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  54.3 
 
 		 345 aa  329  4e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  54.17 
 
 		 320 aa  329  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  52.4 
 
 		 316 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  52.15 
 
 		 332 aa  325  5e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  52.4 
 
 		 316 aa  325  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  53.05 
 
 		 320 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  52.08 
 
 		 316 aa  324  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  53.05 
 
 		 320 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  53.05 
 
 		 320 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  53.05 
 
 		 320 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2621  thioredoxin-disulfide reductase  53.05 
 
 		 320 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105399  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  51.6 
 
 		 316 aa  324  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000407332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3045  thioredoxin-disulfide reductase  53.05 
 
 		 320 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  50.47 
 
 		 334 aa  324  1e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1991  thioredoxin-disulfide reductase  53.05 
 
 		 320 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  52.41 
 
 		 320 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  51.61 
 
 		 317 aa  323  4e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  52.09 
 
 		 320 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  52.09 
 
 		 320 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  52.09 
 
 		 320 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  53.29 
 
 		 314 aa  322  7e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2557  thioredoxin reductase  53.35 
 
 		 318 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  51.28 
 
 		 318 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  52.26 
 
 		 324 aa  321  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2342  thioredoxin reductase oxidoreductase protein  53.67 
 
 		 318 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  52.22 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  51.78 
 
 		 313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  55.74 
 
 		 325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2153  thioredoxin reductase  53.35 
 
 		 318 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.969122  normal  0.900366 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  51.45 
 
 		 320 aa  318  7e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  51.45 
 
 		 346 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0978  thioredoxin reductase  53.75 
 
 		 315 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.993828  normal  0.0140705 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1037  thioredoxin reductase  49.69 
 
 		 333 aa  317  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.526099 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  48.89 
 
 		 316 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  51.9 
 
 		 317 aa  317  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  50.33 
 
 		 314 aa  317  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  51.77 
 
 		 346 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  49.83 
 
 		 326 aa  317  2e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  48.57 
 
 		 316 aa  316  3e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  54.43 
 
 		 325 aa  316  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  51.8 
 
 		 310 aa  316  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  49.84 
 
 		 317 aa  316  4e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  49.38 
 
 		 333 aa  315  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  53.07 
 
 		 316 aa  315  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3328  thioredoxin reductase  50.48 
 
 		 318 aa  315  5e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  50.49 
 
 		 331 aa  315  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0634  thioredoxin reductase  49.4 
 
 		 333 aa  315  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  53.59 
 
 		 321 aa  315  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0684  thioredoxin reductase  50.8 
 
 		 317 aa  315  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00860267  normal  0.703249 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  52.22 
 
 		 326 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  50.65 
 
 		 352 aa  314  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  50.99 
 
 		 322 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  50.48 
 
 		 340 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  52.42 
 
 		 344 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  50.81 
 
 		 361 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  48.4 
 
 		 319 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2959  thioredoxin reductase  52.9 
 
 		 317 aa  312  4.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.457436  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  49.84 
 
 		 319 aa  312  5.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  52.43 
 
 		 316 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  50.48 
 
 		 346 aa  311  6.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  51.45 
 
 		 319 aa  311  9e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  51.6 
 
 		 317 aa  311  9e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  51.94 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  53.11 
 
 		 324 aa  311  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  54.4 
 
 		 314 aa  311  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  48.55 
 
 		 314 aa  310  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  52.79 
 
 		 324 aa  311  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  52.41 
 
 		 320 aa  311  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  53.11 
 
 		 324 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  49.51 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>