More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1151 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  100 
 
 		 311 aa  641    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  84.57 
 
 		 311 aa  558  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  79.42 
 
 		 311 aa  526  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  76.53 
 
 		 311 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  75.56 
 
 		 311 aa  509  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  71.06 
 
 		 311 aa  484  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  71.06 
 
 		 311 aa  478  1e-134  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  61.67 
 
 		 314 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  61.33 
 
 		 314 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  62.05 
 
 		 319 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  61.67 
 
 		 334 aa  386  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  61.33 
 
 		 314 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  60 
 
 		 314 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  58.88 
 
 		 348 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  56.29 
 
 		 312 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  56.29 
 
 		 317 aa  360  1e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  55.3 
 
 		 321 aa  358  7e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  56.62 
 
 		 314 aa  357  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  58.36 
 
 		 325 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  55.3 
 
 		 321 aa  355  5e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  58.63 
 
 		 335 aa  355  6.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  58.22 
 
 		 310 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  57.62 
 
 		 314 aa  353  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  55.63 
 
 		 321 aa  353  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  53.99 
 
 		 325 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  54.55 
 
 		 318 aa  352  5e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  54.22 
 
 		 361 aa  352  5.9999999999999994e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  54.97 
 
 		 345 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  56.58 
 
 		 319 aa  351  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  54.67 
 
 		 314 aa  349  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  53.62 
 
 		 335 aa  348  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  57.1 
 
 		 332 aa  348  6e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  53.05 
 
 		 320 aa  347  1e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  53.05 
 
 		 320 aa  347  1e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  57.43 
 
 		 320 aa  347  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  52.32 
 
 		 331 aa  347  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  54.25 
 
 		 310 aa  347  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  53.92 
 
 		 324 aa  347  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  54.55 
 
 		 320 aa  345  4e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  54.55 
 
 		 320 aa  345  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  54.55 
 
 		 320 aa  345  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  55.81 
 
 		 311 aa  345  5e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  54.43 
 
 		 313 aa  345  5e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  55.37 
 
 		 330 aa  345  6e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  54.25 
 
 		 324 aa  345  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  55.81 
 
 		 320 aa  345  8e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  57.57 
 
 		 314 aa  345  8e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  56.25 
 
 		 310 aa  344  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  53.59 
 
 		 324 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  56.29 
 
 		 321 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  53.12 
 
 		 316 aa  343  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  55.63 
 
 		 321 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  53.33 
 
 		 327 aa  343  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  52.56 
 
 		 324 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  55.7 
 
 		 321 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  53.12 
 
 		 316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  54.25 
 
 		 338 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  55.3 
 
 		 321 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  58.22 
 
 		 348 aa  342  5.999999999999999e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  54.72 
 
 		 323 aa  342  5.999999999999999e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  52.26 
 
 		 316 aa  342  7e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  53.38 
 
 		 317 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  52.26 
 
 		 316 aa  341  1e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  53.64 
 
 		 326 aa  339  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  55.99 
 
 		 317 aa  339  2.9999999999999998e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  54.63 
 
 		 325 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  54.52 
 
 		 456 aa  339  4e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  53.31 
 
 		 316 aa  339  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000407332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  51.92 
 
 		 324 aa  339  4e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  52.24 
 
 		 324 aa  339  4e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  55.59 
 
 		 310 aa  338  5.9999999999999996e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0563  thioredoxin reductase  53.67 
 
 		 326 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0552475  normal  0.0148693 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  53.85 
 
 		 322 aa  338  8e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  54.51 
 
 		 334 aa  338  9e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  53.21 
 
 		 318 aa  337  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  54.13 
 
 		 331 aa  337  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  58.42 
 
 		 325 aa  338  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  55.92 
 
 		 331 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  54.52 
 
 		 461 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  55.91 
 
 		 317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  54.52 
 
 		 461 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  58.69 
 
 		 327 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  54.69 
 
 		 458 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  52.58 
 
 		 319 aa  336  3.9999999999999995e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  54.22 
 
 		 313 aa  335  5.999999999999999e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  55.91 
 
 		 362 aa  335  5.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2017  thioredoxin reductase  51.28 
 
 		 317 aa  335  7e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000213161  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  54.34 
 
 		 333 aa  335  7.999999999999999e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  51.46 
 
 		 317 aa  334  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  55.37 
 
 		 320 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2014  thioredoxin reductase  51.13 
 
 		 317 aa  334  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000856982  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  52.94 
 
 		 324 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  53.23 
 
 		 333 aa  334  1e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  54.55 
 
 		 320 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  51.8 
 
 		 323 aa  333  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  54.55 
 
 		 320 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  54.55 
 
 		 320 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  54.55 
 
 		 320 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1959  thioredoxin reductase  51.46 
 
 		 317 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000155114  normal  0.552411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  51.46 
 
 		 317 aa  333  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000827938  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>