More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4503 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  100 
 
 		 346 aa  697    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  71.78 
 
 		 330 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  73.08 
 
 		 340 aa  471  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  70.3 
 
 		 359 aa  474  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  70.03 
 
 		 319 aa  461  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  71.94 
 
 		 310 aa  463  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  71.66 
 
 		 333 aa  454  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  69.62 
 
 		 313 aa  454  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  71.66 
 
 		 332 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  71.2 
 
 		 310 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  69.21 
 
 		 344 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  67.54 
 
 		 310 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  71.43 
 
 		 309 aa  437  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  64.56 
 
 		 353 aa  435  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  69.09 
 
 		 325 aa  431  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  68.4 
 
 		 329 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  70.25 
 
 		 329 aa  433  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  65.35 
 
 		 348 aa  425  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  67.65 
 
 		 317 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  61.86 
 
 		 318 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  72.17 
 
 		 327 aa  416  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  62.99 
 
 		 318 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  64.04 
 
 		 330 aa  412  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  68.08 
 
 		 348 aa  413  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  67.1 
 
 		 331 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  65.15 
 
 		 310 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  65.15 
 
 		 330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  63.91 
 
 		 333 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  63.91 
 
 		 333 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  63.91 
 
 		 333 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  60.99 
 
 		 333 aa  402  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  62.26 
 
 		 335 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  63.69 
 
 		 331 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  65.61 
 
 		 327 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  63.06 
 
 		 336 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  62.05 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  61.66 
 
 		 318 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  65.79 
 
 		 325 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  59.48 
 
 		 313 aa  378  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  63.58 
 
 		 317 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  63.58 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  56.66 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  56.72 
 
 		 319 aa  351  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  59.24 
 
 		 320 aa  345  6e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  57.74 
 
 		 325 aa  343  4e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  52.41 
 
 		 339 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  57.52 
 
 		 325 aa  338  7e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  56.95 
 
 		 314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  56.54 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  56.62 
 
 		 314 aa  335  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  53.92 
 
 		 334 aa  334  1e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  53.33 
 
 		 334 aa  331  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  55.17 
 
 		 320 aa  329  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  51.43 
 
 		 461 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  51.43 
 
 		 461 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  49.55 
 
 		 460 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  52.29 
 
 		 311 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  48.41 
 
 		 456 aa  325  7e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  49.36 
 
 		 326 aa  324  2e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  52.63 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  56.62 
 
 		 314 aa  322  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  52.87 
 
 		 311 aa  321  9.000000000000001e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  51.31 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  48.52 
 
 		 315 aa  317  1e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  52.61 
 
 		 335 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  52.61 
 
 		 311 aa  315  8e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  53.8 
 
 		 320 aa  315  9e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  46.51 
 
 		 453 aa  314  9.999999999999999e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  52.46 
 
 		 311 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0375  thioredoxin reductase  52.13 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  53.25 
 
 		 318 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  51.97 
 
 		 321 aa  311  7.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  52.3 
 
 		 317 aa  311  9e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  52.3 
 
 		 312 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  51.97 
 
 		 316 aa  310  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  51.31 
 
 		 326 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  53.92 
 
 		 320 aa  309  5e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  49.55 
 
 		 458 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  52.44 
 
 		 313 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  50.99 
 
 		 321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  50.49 
 
 		 311 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  50.33 
 
 		 331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  48.9 
 
 		 314 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  53.4 
 
 		 321 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  47.87 
 
 		 332 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  50.66 
 
 		 321 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  47.57 
 
 		 320 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  52.27 
 
 		 321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  47.44 
 
 		 323 aa  303  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  49.51 
 
 		 321 aa  301  9e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  47.59 
 
 		 319 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  49.67 
 
 		 324 aa  300  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  53.82 
 
 		 314 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1269  thioredoxin reductase  50.66 
 
 		 309 aa  300  3e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  48.89 
 
 		 324 aa  300  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  47.91 
 
 		 322 aa  299  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  46.77 
 
 		 322 aa  299  5e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  51.95 
 
 		 321 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  47.65 
 
 		 324 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  48.28 
 
 		 323 aa  297  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>