More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1337 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  100 
 
 
311 aa  644    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  58.75 
 
 
334 aa  360  2e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  57.28 
 
 
332 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  56.45 
 
 
311 aa  350  1e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  56.45 
 
 
311 aa  350  1e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  55.96 
 
 
314 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  55.96 
 
 
314 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  56.58 
 
 
314 aa  347  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  55.81 
 
 
311 aa  345  5e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  55.66 
 
 
311 aa  342  5.999999999999999e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  55.16 
 
 
311 aa  341  1e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  53.99 
 
 
314 aa  340  2.9999999999999998e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  54.69 
 
 
311 aa  336  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  51.94 
 
 
311 aa  332  4e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  53.77 
 
 
333 aa  332  5e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  55.3 
 
 
314 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  54.93 
 
 
319 aa  329  3e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  55.63 
 
 
314 aa  326  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  50.99 
 
 
310 aa  318  9e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  52.75 
 
 
319 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  54.02 
 
 
314 aa  316  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  50 
 
 
314 aa  314  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  51.75 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  54.83 
 
 
334 aa  313  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  51.8 
 
 
321 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  52.58 
 
 
310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  52.13 
 
 
321 aa  312  5.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  54.46 
 
 
314 aa  312  5.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  52.52 
 
 
320 aa  311  6.999999999999999e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  50.97 
 
 
331 aa  311  6.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  50.65 
 
 
331 aa  311  7.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  50.99 
 
 
316 aa  311  9e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  51.79 
 
 
320 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  49.03 
 
 
330 aa  311  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  51.79 
 
 
320 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  50.65 
 
 
323 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  51.61 
 
 
336 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  50.98 
 
 
348 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  50.65 
 
 
323 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  53.09 
 
 
345 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  51.49 
 
 
321 aa  309  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  52.27 
 
 
335 aa  309  5e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  51.46 
 
 
325 aa  309  5e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0981  thioredoxin-disulfide reductase  51.47 
 
 
317 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.708131  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  51.77 
 
 
333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  51.77 
 
 
333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  51.77 
 
 
333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  50.81 
 
 
320 aa  306  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0735  thioredoxin-disulfide reductase  49.51 
 
 
318 aa  306  3e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  50.81 
 
 
320 aa  306  3e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  50.81 
 
 
320 aa  306  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  50.82 
 
 
322 aa  305  8.000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  50 
 
 
310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  50.8 
 
 
313 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  51.62 
 
 
316 aa  303  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  51.43 
 
 
320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4219  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.61 
 
 
346 aa  302  4.0000000000000003e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1269  thioredoxin reductase  48.18 
 
 
309 aa  301  6.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1134  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
313 aa  301  9e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.788555 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  50.17 
 
 
320 aa  301  9e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  50 
 
 
332 aa  300  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  50.97 
 
 
330 aa  300  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  51.14 
 
 
320 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  50.81 
 
 
317 aa  300  2e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  51.14 
 
 
346 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  50.97 
 
 
316 aa  300  3e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  49.2 
 
 
325 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  51.29 
 
 
321 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  49.68 
 
 
310 aa  299  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  47.52 
 
 
327 aa  299  4e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  48.26 
 
 
318 aa  299  4e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  46.91 
 
 
326 aa  299  4e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  51.14 
 
 
320 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  51.14 
 
 
320 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  51.14 
 
 
320 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
361 aa  298  5e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  50.49 
 
 
318 aa  298  5e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  50 
 
 
318 aa  299  5e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  46.65 
 
 
323 aa  298  8e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  50 
 
 
323 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  49.53 
 
 
460 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  47.81 
 
 
320 aa  297  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3213  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
314 aa  298  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.166551  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  51.16 
 
 
324 aa  296  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  47.28 
 
 
361 aa  296  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2601  thioredoxin reductase  49.52 
 
 
321 aa  296  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0331  thioredoxin reductase  48.22 
 
 
321 aa  297  2e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  50.47 
 
 
316 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1959  thioredoxin reductase  49.51 
 
 
317 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000155114  normal  0.552411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2017  thioredoxin reductase  49.51 
 
 
317 aa  296  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000213161  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  49.51 
 
 
317 aa  296  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000827938  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  51.13 
 
 
346 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  49.35 
 
 
319 aa  296  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  51.15 
 
 
321 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  49.51 
 
 
318 aa  296  3e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  49.35 
 
 
317 aa  296  4e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  49.84 
 
 
316 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  50.65 
 
 
321 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
320 aa  295  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  48.41 
 
 
321 aa  295  6e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>