More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3812 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  72.09 
 
 
453 aa  691    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  72.81 
 
 
456 aa  705    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  100 
 
 
460 aa  952    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  71.58 
 
 
461 aa  690    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  71.58 
 
 
461 aa  690    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  69.52 
 
 
458 aa  665    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0623  thioredoxin reductase  66.81 
 
 
459 aa  617  1e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66148  normal  0.453769 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28227  predicted protein  59.57 
 
 
547 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0120159 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0680  thioredoxin reductase  57.17 
 
 
457 aa  547  1e-154  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13151  putative thioredoxin reductase  57.78 
 
 
458 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1981  thioredoxin reductase  56.83 
 
 
460 aa  536  1e-151  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0833552 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0758  thioredoxin reductase  56.32 
 
 
458 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18111  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13401  putative thioredoxin reductase  56.73 
 
 
458 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.327116  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15981  putative thioredoxin reductase  56.17 
 
 
458 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1247  thioredoxin reductase  55.87 
 
 
458 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13251  putative thioredoxin reductase  55.82 
 
 
458 aa  521  1e-147  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12241  putative thioredoxin reductase  56 
 
 
463 aa  504  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0425145  normal  0.220782 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59792  Thioredoxin reductase  59.11 
 
 
319 aa  376  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01260  thioredoxin-disulfide reductase, putative  58.95 
 
 
371 aa  376  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03581  Thioredoxin reductase (EC 1.8.1.9) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q08GE2]  56.33 
 
 
339 aa  368  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.813979  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0375  thioredoxin reductase  55.73 
 
 
312 aa  360  2e-98  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  57.05 
 
 
314 aa  359  5e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  57.05 
 
 
314 aa  359  6e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  54.66 
 
 
314 aa  352  7e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  52.83 
 
 
319 aa  352  7e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  54.02 
 
 
310 aa  352  8.999999999999999e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  55.99 
 
 
334 aa  350  4e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  52.29 
 
 
326 aa  349  5e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  55.77 
 
 
322 aa  348  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  57.37 
 
 
314 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1633  thioredoxin reductase  51.45 
 
 
349 aa  344  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  54.37 
 
 
310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  55.52 
 
 
327 aa  342  5.999999999999999e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  54.29 
 
 
313 aa  335  1e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  53.17 
 
 
325 aa  334  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  54.58 
 
 
319 aa  332  6e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  54.05 
 
 
311 aa  332  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  52.75 
 
 
348 aa  331  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  53.14 
 
 
320 aa  331  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  53.4 
 
 
311 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  54.05 
 
 
311 aa  329  6e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  53.33 
 
 
315 aa  328  9e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  49.55 
 
 
346 aa  326  5e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  51.44 
 
 
334 aa  326  5e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  52.2 
 
 
320 aa  326  5e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  54.34 
 
 
314 aa  326  5e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  51.1 
 
 
314 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  54.02 
 
 
327 aa  325  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  51.42 
 
 
345 aa  324  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  52.44 
 
 
332 aa  323  5e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  54.05 
 
 
311 aa  323  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  50 
 
 
323 aa  323  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  50.96 
 
 
336 aa  322  7e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  53.23 
 
 
311 aa  322  8e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  50 
 
 
310 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  48.04 
 
 
359 aa  320  3.9999999999999996e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  52.23 
 
 
311 aa  320  3.9999999999999996e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  51.79 
 
 
315 aa  319  5e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
310 aa  319  6e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  53.23 
 
 
309 aa  318  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  48.91 
 
 
330 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
331 aa  317  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_002950  PG1134  thioredoxin reductase  52.08 
 
 
313 aa  317  3e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.788555 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  50.31 
 
 
331 aa  315  9.999999999999999e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  52.09 
 
 
348 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0199  thioredoxin reductase  51.94 
 
 
315 aa  313  3.9999999999999997e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  50.78 
 
 
313 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  51.43 
 
 
332 aa  313  4.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  50.31 
 
 
361 aa  312  9e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  49.68 
 
 
331 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
333 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  48.92 
 
 
317 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
333 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
333 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  52.15 
 
 
320 aa  311  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  55.31 
 
 
317 aa  310  5e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
311 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  50.64 
 
 
325 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  50.63 
 
 
321 aa  309  6.999999999999999e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  51.27 
 
 
321 aa  309  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  50.63 
 
 
314 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
321 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  52.27 
 
 
325 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  51.37 
 
 
335 aa  308  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  47.84 
 
 
320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  47.84 
 
 
320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  50.78 
 
 
321 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  51.78 
 
 
329 aa  307  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  50.47 
 
 
317 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
332 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  46.71 
 
 
333 aa  306  5.0000000000000004e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  50.47 
 
 
312 aa  306  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  48.44 
 
 
318 aa  306  7e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  48.75 
 
 
322 aa  305  8.000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  50.16 
 
 
353 aa  305  8.000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  48.24 
 
 
340 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  46.48 
 
 
323 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  46.48 
 
 
323 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  48.44 
 
 
319 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  51.1 
 
 
321 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>