More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0375 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0375  thioredoxin reductase  100 
 
 
312 aa  643    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  56.86 
 
 
456 aa  365  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59792  Thioredoxin reductase  56.11 
 
 
319 aa  364  1e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  55.73 
 
 
460 aa  360  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  56.21 
 
 
453 aa  360  2e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  56.35 
 
 
458 aa  357  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03581  Thioredoxin reductase (EC 1.8.1.9) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q08GE2]  56.04 
 
 
339 aa  356  2.9999999999999997e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.813979  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  55.31 
 
 
310 aa  353  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  54.66 
 
 
319 aa  340  1e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13151  putative thioredoxin reductase  54.58 
 
 
458 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1981  thioredoxin reductase  53.55 
 
 
460 aa  339  4e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0833552 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0680  thioredoxin reductase  53.09 
 
 
457 aa  336  2.9999999999999997e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01260  thioredoxin-disulfide reductase, putative  52.52 
 
 
371 aa  334  9e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  52.92 
 
 
461 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  52.92 
 
 
461 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  55.91 
 
 
319 aa  331  8e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13401  putative thioredoxin reductase  53.42 
 
 
458 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.327116  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  54.69 
 
 
314 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  54.69 
 
 
314 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0623  thioredoxin reductase  53.21 
 
 
459 aa  329  4e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66148  normal  0.453769 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13251  putative thioredoxin reductase  53.42 
 
 
458 aa  328  6e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1247  thioredoxin reductase  53.09 
 
 
458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  50.8 
 
 
310 aa  322  5e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  52.12 
 
 
348 aa  321  8e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  53.07 
 
 
334 aa  321  8e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15981  putative thioredoxin reductase  51.3 
 
 
458 aa  321  8e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0758  thioredoxin reductase  50.97 
 
 
458 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18111  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28227  predicted protein  50.16 
 
 
547 aa  318  5e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0120159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  52.48 
 
 
310 aa  319  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  52.05 
 
 
320 aa  316  3e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12241  putative thioredoxin reductase  49.84 
 
 
463 aa  314  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0425145  normal  0.220782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  52.13 
 
 
346 aa  313  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  54.69 
 
 
314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  53.38 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  55.08 
 
 
325 aa  309  4e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  49.84 
 
 
323 aa  309  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
323 aa  309  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0703  thioredoxin reductase  50.94 
 
 
321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  53.72 
 
 
314 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0791  thioredoxin reductase  50.94 
 
 
321 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  51.16 
 
 
336 aa  306  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1633  thioredoxin reductase  48.99 
 
 
349 aa  306  4.0000000000000004e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  50.63 
 
 
316 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  52.61 
 
 
340 aa  305  7e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  50.32 
 
 
353 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  50.32 
 
 
313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  50 
 
 
316 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01037  thioredoxin-disulfide reductase  50 
 
 
322 aa  301  7.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.088167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06129  thioredoxin-disulfide reductase  50 
 
 
322 aa  301  7.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345376  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1982  thioredoxin reductase  49.53 
 
 
328 aa  300  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.343784  normal  0.438815 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1360  thioredoxin reductase  49.37 
 
 
332 aa  300  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  48.86 
 
 
333 aa  300  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  50.94 
 
 
317 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  49.51 
 
 
318 aa  300  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  50.17 
 
 
331 aa  299  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  49.19 
 
 
314 aa  298  6e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  50.49 
 
 
318 aa  298  7e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1932  thioredoxin reductase  49.53 
 
 
323 aa  298  7e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  48.86 
 
 
332 aa  298  8e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  48.53 
 
 
359 aa  298  9e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  50.17 
 
 
333 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  50.17 
 
 
333 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  50.8 
 
 
329 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  50.17 
 
 
333 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  49.53 
 
 
318 aa  296  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  48.41 
 
 
323 aa  296  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  50.49 
 
 
318 aa  296  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  49.36 
 
 
313 aa  296  3e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  49.69 
 
 
323 aa  296  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  47.71 
 
 
330 aa  296  4e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  51.62 
 
 
320 aa  295  6e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  52.44 
 
 
325 aa  295  6e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  50.81 
 
 
315 aa  295  6e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  48.43 
 
 
316 aa  295  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3427  thioredoxin reductase  50.93 
 
 
319 aa  295  7e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116946  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  47.25 
 
 
334 aa  295  8e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4032  thioredoxin reductase  50.47 
 
 
316 aa  295  8e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000634849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  49.53 
 
 
316 aa  295  9e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  48.72 
 
 
331 aa  294  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  50.49 
 
 
311 aa  294  1e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  50.49 
 
 
330 aa  294  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
320 aa  294  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  49.53 
 
 
318 aa  294  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3383  thioredoxin reductase  50 
 
 
317 aa  294  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3179  thioredoxin reductase  49.22 
 
 
316 aa  295  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  48.72 
 
 
322 aa  294  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  48.72 
 
 
327 aa  294  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  49.84 
 
 
332 aa  294  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  48.42 
 
 
320 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  48.88 
 
 
316 aa  293  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0023  thioredoxin reductase  49.53 
 
 
316 aa  293  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  49.2 
 
 
324 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  50 
 
 
317 aa  294  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  50.49 
 
 
348 aa  293  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
320 aa  293  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  48.1 
 
 
320 aa  292  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  49.68 
 
 
320 aa  292  5e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  49.21 
 
 
319 aa  291  6e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1283  thioredoxin reductase  49.69 
 
 
319 aa  291  7e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1269  thioredoxin reductase  51.29 
 
 
309 aa  291  8e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>