More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0181 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  100 
 
 		 334 aa  684    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  60.46 
 
 		 314 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  67.54 
 
 		 332 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  62.01 
 
 		 314 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  62.01 
 
 		 314 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  62.7 
 
 		 319 aa  395  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  59.93 
 
 		 319 aa  388  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  61.67 
 
 		 311 aa  391  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  64.17 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  58.15 
 
 		 323 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  58.44 
 
 		 320 aa  385  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  61.67 
 
 		 311 aa  386  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  57.1 
 
 		 315 aa  386  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  61.17 
 
 		 320 aa  384  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  63.16 
 
 		 310 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  62.99 
 
 		 314 aa  381  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  59.67 
 
 		 311 aa  382  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  58.58 
 
 		 322 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  59.42 
 
 		 314 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  59.67 
 
 		 311 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  59.6 
 
 		 311 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  61.81 
 
 		 348 aa  378  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  60.07 
 
 		 315 aa  380  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  57.42 
 
 		 327 aa  378  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  61 
 
 		 311 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  61.32 
 
 		 320 aa  377  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  62.34 
 
 		 314 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  60.2 
 
 		 311 aa  377  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  63.06 
 
 		 327 aa  375  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  59.02 
 
 		 310 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  56.59 
 
 		 326 aa  371  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  57.32 
 
 		 330 aa  366  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  59.62 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  59.54 
 
 		 331 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  60.38 
 
 		 318 aa  364  1e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  59.21 
 
 		 336 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  56.86 
 
 		 313 aa  361  8e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  58.75 
 
 		 311 aa  360  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  58.69 
 
 		 345 aa  360  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  56.09 
 
 		 323 aa  358  7e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  56.09 
 
 		 323 aa  358  7e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  55.99 
 
 		 331 aa  357  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  60.06 
 
 		 348 aa  356  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  59.48 
 
 		 314 aa  355  3.9999999999999996e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  56.77 
 
 		 330 aa  355  5.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  58.61 
 
 		 310 aa  355  5.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  58.58 
 
 		 458 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  56.82 
 
 		 330 aa  354  1e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  58.42 
 
 		 333 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  58.42 
 
 		 333 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  58.42 
 
 		 333 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  55.14 
 
 		 323 aa  352  4e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1134  thioredoxin reductase  54.84 
 
 		 313 aa  351  8.999999999999999e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.788555 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  60.86 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  54.34 
 
 		 320 aa  349  3e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0735  thioredoxin-disulfide reductase  53.87 
 
 		 318 aa  349  3e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  54.34 
 
 		 320 aa  349  3e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  55.99 
 
 		 460 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  56.35 
 
 		 456 aa  349  4e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  55.1 
 
 		 317 aa  349  4e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  57.42 
 
 		 317 aa  348  7e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  56.91 
 
 		 316 aa  347  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  55.74 
 
 		 321 aa  347  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  57.23 
 
 		 316 aa  348  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  59.74 
 
 		 325 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  55.77 
 
 		 316 aa  346  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0331  thioredoxin reductase  53.23 
 
 		 321 aa  346  3e-94  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  53.09 
 
 		 318 aa  346  3e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  55.73 
 
 		 332 aa  345  5e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  57.32 
 
 		 335 aa  345  5e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  54.49 
 
 		 331 aa  345  6e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  56.96 
 
 		 314 aa  345  7e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  53.44 
 
 		 320 aa  343  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  55.66 
 
 		 313 aa  344  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  55.08 
 
 		 321 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  53.82 
 
 		 334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  57.28 
 
 		 314 aa  343  2.9999999999999997e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  54.29 
 
 		 321 aa  342  4e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  54.95 
 
 		 324 aa  342  5e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  54.97 
 
 		 318 aa  342  5.999999999999999e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  55.41 
 
 		 321 aa  342  7e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  53.35 
 
 		 352 aa  341  9e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  55.45 
 
 		 333 aa  341  1e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  55.23 
 
 		 311 aa  341  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  54.49 
 
 		 361 aa  341  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  54.26 
 
 		 335 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2342  thioredoxin reductase oxidoreductase protein  54.4 
 
 		 318 aa  340  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  55.02 
 
 		 453 aa  340  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  53.85 
 
 		 316 aa  339  2.9999999999999998e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  53.5 
 
 		 316 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  54.9 
 
 		 312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  53.53 
 
 		 316 aa  337  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  53.14 
 
 		 310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  54.9 
 
 		 317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  53.21 
 
 		 326 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  54.14 
 
 		 333 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  56.13 
 
 		 334 aa  336  3.9999999999999995e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  51.22 
 
 		 346 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  53.7 
 
 		 320 aa  335  7e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  53.35 
 
 		 317 aa  335  7.999999999999999e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>