More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0758 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_12241  putative thioredoxin reductase  70.26 
 
 		 463 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0425145  normal  0.220782 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0758  thioredoxin reductase  100 
 
 		 458 aa  943    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18111  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0680  thioredoxin reductase  68.53 
 
 		 457 aa  669    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1981  thioredoxin reductase  68.47 
 
 		 460 aa  662    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0833552 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1247  thioredoxin reductase  67.03 
 
 		 458 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13151  putative thioredoxin reductase  67.32 
 
 		 458 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15981  putative thioredoxin reductase  96.51 
 
 		 458 aa  916    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13251  putative thioredoxin reductase  67.03 
 
 		 458 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13401  putative thioredoxin reductase  66.59 
 
 		 458 aa  628  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.327116  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  59.48 
 
 		 458 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  59.07 
 
 		 456 aa  551  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  57.66 
 
 		 453 aa  535  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  56.32 
 
 		 460 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  56.17 
 
 		 461 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  56.17 
 
 		 461 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0623  thioredoxin reductase  56.35 
 
 		 459 aa  505  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66148  normal  0.453769 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28227  predicted protein  51.32 
 
 		 547 aa  478  1e-133  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0120159 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59792  Thioredoxin reductase  52.56 
 
 		 319 aa  330  3e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01260  thioredoxin-disulfide reductase, putative  52.4 
 
 		 371 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1633  thioredoxin reductase  48.99 
 
 		 349 aa  323  4e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03581  Thioredoxin reductase (EC 1.8.1.9) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q08GE2]  52.22 
 
 		 339 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.813979  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0375  thioredoxin reductase  50.97 
 
 		 312 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  48.73 
 
 		 319 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  45.78 
 
 		 334 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  47.65 
 
 		 314 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1134  thioredoxin reductase  49.68 
 
 		 313 aa  301  2e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.788555 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  49.04 
 
 		 334 aa  297  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  46.5 
 
 		 348 aa  296  7e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  47.88 
 
 		 310 aa  295  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  48.1 
 
 		 322 aa  293  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  50.48 
 
 		 325 aa  293  6e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  47.53 
 
 		 327 aa  292  9e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  47.95 
 
 		 314 aa  292  9e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  47.76 
 
 		 314 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  48.21 
 
 		 326 aa  290  3e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  47.71 
 
 		 315 aa  290  4e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  48.91 
 
 		 327 aa  289  6e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  47.44 
 
 		 314 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  46.43 
 
 		 311 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  45.37 
 
 		 310 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  45.57 
 
 		 353 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  47.87 
 
 		 310 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  48.08 
 
 		 323 aa  286  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  47.91 
 
 		 319 aa  286  5.999999999999999e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  47.12 
 
 		 311 aa  286  7e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  47.88 
 
 		 332 aa  286  7e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  47.3 
 
 		 315 aa  286  8e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  46.15 
 
 		 311 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  46.47 
 
 		 311 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  46.93 
 
 		 333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  47.3 
 
 		 325 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  46.01 
 
 		 323 aa  282  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  46.01 
 
 		 323 aa  282  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  46.2 
 
 		 320 aa  281  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  46.25 
 
 		 340 aa  281  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  43.84 
 
 		 359 aa  280  3e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0199  thioredoxin reductase  47.56 
 
 		 315 aa  280  4e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  45.81 
 
 		 330 aa  279  6e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  46.86 
 
 		 319 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  46.28 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  44.44 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  46.91 
 
 		 309 aa  278  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1269  thioredoxin reductase  47.27 
 
 		 309 aa  277  3e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  46.2 
 
 		 320 aa  277  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  46.2 
 
 		 320 aa  277  4e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  44.26 
 
 		 310 aa  276  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  46.2 
 
 		 320 aa  277  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  47.12 
 
 		 320 aa  276  5e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  44.84 
 
 		 311 aa  276  5e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  44.01 
 
 		 331 aa  276  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  45.94 
 
 		 319 aa  276  7e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  43.73 
 
 		 346 aa  276  7e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  43.41 
 
 		 333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  43.41 
 
 		 333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  43.41 
 
 		 333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  46.15 
 
 		 311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  46.06 
 
 		 311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  45.43 
 
 		 318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  46.71 
 
 		 317 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  44.16 
 
 		 336 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  45.37 
 
 		 320 aa  273  5.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0703  thioredoxin reductase  45.94 
 
 		 321 aa  273  6e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0791  thioredoxin reductase  45.94 
 
 		 321 aa  273  6e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  47.76 
 
 		 314 aa  273  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  45.19 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  48.41 
 
 		 314 aa  271  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  47.92 
 
 		 316 aa  270  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  45.74 
 
 		 320 aa  270  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  46.79 
 
 		 345 aa  270  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  46.89 
 
 		 333 aa  270  5e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  45.28 
 
 		 333 aa  270  5.9999999999999995e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  45.71 
 
 		 352 aa  269  8e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  45.28 
 
 		 318 aa  269  8e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  41.18 
 
 		 330 aa  269  8.999999999999999e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  45.45 
 
 		 319 aa  269  8.999999999999999e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  45.25 
 
 		 318 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1057  thioredoxin reductase  47.34 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00951777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  47.04 
 
 		 320 aa  268  1e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  47.04 
 
 		 320 aa  268  1e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  46.86 
 
 		 320 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>