More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_59792 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_59792  Thioredoxin reductase  100 
 
 
319 aa  664    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01260  thioredoxin-disulfide reductase, putative  67.4 
 
 
371 aa  459  9.999999999999999e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03581  Thioredoxin reductase (EC 1.8.1.9) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q08GE2]  66.15 
 
 
339 aa  445  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.813979  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  59.11 
 
 
460 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0375  thioredoxin reductase  56.11 
 
 
312 aa  364  1e-99  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  57.51 
 
 
458 aa  360  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  54.02 
 
 
461 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  54.02 
 
 
461 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  54.98 
 
 
456 aa  348  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  53.99 
 
 
453 aa  343  2.9999999999999997e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  52.05 
 
 
322 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1981  thioredoxin reductase  50.8 
 
 
460 aa  331  1e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0833552 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0623  thioredoxin reductase  55.63 
 
 
459 aa  331  1e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66148  normal  0.453769 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  52.68 
 
 
314 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0758  thioredoxin reductase  52.56 
 
 
458 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18111  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  52.68 
 
 
314 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15981  putative thioredoxin reductase  52.56 
 
 
458 aa  328  6e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0680  thioredoxin reductase  50.64 
 
 
457 aa  327  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28227  predicted protein  50.32 
 
 
547 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0120159 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  51.12 
 
 
313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13151  putative thioredoxin reductase  53.35 
 
 
458 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
327 aa  325  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  51.1 
 
 
334 aa  323  4e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  50.31 
 
 
319 aa  317  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  53 
 
 
314 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13251  putative thioredoxin reductase  50.48 
 
 
458 aa  315  5e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12241  putative thioredoxin reductase  50.8 
 
 
463 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0425145  normal  0.220782 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
334 aa  311  1e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13401  putative thioredoxin reductase  49.52 
 
 
458 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.327116  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1247  thioredoxin reductase  49.52 
 
 
458 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  47.15 
 
 
314 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  51.88 
 
 
314 aa  309  2.9999999999999997e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0199  thioredoxin reductase  48.26 
 
 
315 aa  309  4e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  48.24 
 
 
326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  51.42 
 
 
314 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
320 aa  306  3e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  49.2 
 
 
310 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  50 
 
 
320 aa  300  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  48.42 
 
 
345 aa  300  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0735  thioredoxin-disulfide reductase  48.29 
 
 
318 aa  300  2e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  47.28 
 
 
332 aa  300  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  49.21 
 
 
314 aa  300  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1633  thioredoxin reductase  47.58 
 
 
349 aa  300  3e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
325 aa  299  4e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  49.2 
 
 
315 aa  297  2e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  48.71 
 
 
311 aa  296  4e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  48.25 
 
 
313 aa  295  5e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  49.08 
 
 
317 aa  295  9e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  49.53 
 
 
313 aa  294  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  48.24 
 
 
315 aa  295  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0703  thioredoxin reductase  48.76 
 
 
321 aa  294  2e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  47.28 
 
 
310 aa  293  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0791  thioredoxin reductase  48.76 
 
 
321 aa  294  2e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  46.67 
 
 
323 aa  293  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  47.77 
 
 
348 aa  292  5e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  49.23 
 
 
317 aa  291  9e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  48.44 
 
 
316 aa  290  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  48.44 
 
 
316 aa  290  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  47.1 
 
 
311 aa  290  2e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  46.52 
 
 
321 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  47.02 
 
 
321 aa  290  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  47.37 
 
 
318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  47.1 
 
 
311 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  47.34 
 
 
332 aa  288  6e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  47.66 
 
 
324 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  47.8 
 
 
325 aa  287  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  48.12 
 
 
320 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  48.12 
 
 
320 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  47.47 
 
 
361 aa  287  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  48.12 
 
 
320 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  48.12 
 
 
320 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  47.65 
 
 
331 aa  287  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  47.35 
 
 
324 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  48.12 
 
 
320 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1134  thioredoxin reductase  45.14 
 
 
313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.788555 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0331  thioredoxin reductase  46.18 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  46.65 
 
 
319 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  47.5 
 
 
317 aa  286  4e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  46.69 
 
 
320 aa  286  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  46.6 
 
 
324 aa  285  5.999999999999999e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  44.83 
 
 
316 aa  285  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  45.79 
 
 
323 aa  285  7e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  48.44 
 
 
319 aa  285  7e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  45.79 
 
 
323 aa  285  7e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  47.81 
 
 
316 aa  285  8e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000407332  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0887  thioredoxin reductase  47.5 
 
 
320 aa  285  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  46.23 
 
 
320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  48.44 
 
 
319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  46.65 
 
 
333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  45.22 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  45.71 
 
 
321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  47.98 
 
 
319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  46.35 
 
 
331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  48.75 
 
 
334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  47.5 
 
 
320 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  47.47 
 
 
324 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  45.57 
 
 
321 aa  282  5.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  46.3 
 
 
359 aa  282  5.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  46.35 
 
 
336 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1713  thioredoxin reductase  46.3 
 
 
317 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000742143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>