More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1226 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  100 
 
 
325 aa  665    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  64.61 
 
 
310 aa  409  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  64.17 
 
 
334 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  63.67 
 
 
319 aa  404  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  64.45 
 
 
332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  63.43 
 
 
310 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  61.67 
 
 
314 aa  394  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  61.67 
 
 
314 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  60.52 
 
 
311 aa  389  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  60.33 
 
 
311 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  58.99 
 
 
348 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  60.26 
 
 
310 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  58.55 
 
 
310 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  61.17 
 
 
319 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  60 
 
 
311 aa  378  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  62.33 
 
 
314 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  60.26 
 
 
311 aa  376  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  61.04 
 
 
336 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  60.84 
 
 
311 aa  377  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  59.62 
 
 
320 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  60.06 
 
 
314 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  58.36 
 
 
311 aa  374  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  55.62 
 
 
330 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  57.93 
 
 
331 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  60.87 
 
 
331 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  58.86 
 
 
333 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  57.14 
 
 
359 aa  369  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  58.86 
 
 
333 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  58.25 
 
 
311 aa  368  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  58.86 
 
 
333 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  58.71 
 
 
313 aa  365  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  60.53 
 
 
348 aa  365  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  58.04 
 
 
458 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  60.47 
 
 
325 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  60.38 
 
 
317 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  62.95 
 
 
309 aa  363  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  57.74 
 
 
346 aa  362  5.0000000000000005e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  60.7 
 
 
362 aa  361  8e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  55.49 
 
 
353 aa  360  1e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  57.57 
 
 
330 aa  359  3e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  57.32 
 
 
320 aa  359  4e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  59.34 
 
 
332 aa  359  5e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  56.59 
 
 
314 aa  357  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  57.19 
 
 
340 aa  357  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  53.48 
 
 
320 aa  356  2.9999999999999997e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  53.48 
 
 
320 aa  356  2.9999999999999997e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  58.75 
 
 
330 aa  355  5.999999999999999e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  54.26 
 
 
317 aa  353  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  58.2 
 
 
313 aa  353  2e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  52.38 
 
 
456 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  56.55 
 
 
326 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  53.17 
 
 
460 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  57.98 
 
 
333 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  58.69 
 
 
329 aa  351  8e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  53.59 
 
 
323 aa  351  8.999999999999999e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  53.59 
 
 
323 aa  351  8.999999999999999e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  56.49 
 
 
335 aa  351  8.999999999999999e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  54.19 
 
 
352 aa  351  1e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  57.1 
 
 
321 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  59.16 
 
 
327 aa  350  2e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5364  thioredoxin reductase  53.94 
 
 
337 aa  349  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  53.33 
 
 
319 aa  349  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  55.56 
 
 
318 aa  349  3e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  57.1 
 
 
321 aa  349  4e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  55.06 
 
 
320 aa  349  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  54.46 
 
 
314 aa  349  4e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  58.99 
 
 
320 aa  349  5e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  60.59 
 
 
344 aa  348  6e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  56.62 
 
 
333 aa  348  7e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  54.43 
 
 
320 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  54.43 
 
 
320 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  54.43 
 
 
320 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1037  thioredoxin reductase  52.83 
 
 
333 aa  348  7e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.526099 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  55.38 
 
 
361 aa  348  8e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  53.14 
 
 
333 aa  347  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  54.29 
 
 
320 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0634  thioredoxin reductase  54.92 
 
 
333 aa  347  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  57.89 
 
 
333 aa  347  2e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  54.11 
 
 
314 aa  347  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  56.58 
 
 
315 aa  347  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  54.29 
 
 
346 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  56.59 
 
 
313 aa  346  2e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  56.77 
 
 
321 aa  346  3e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  53 
 
 
316 aa  346  4e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  55.95 
 
 
317 aa  345  4e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  55.95 
 
 
312 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  52.68 
 
 
316 aa  345  7e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  54.63 
 
 
320 aa  345  8e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  60.13 
 
 
325 aa  345  8e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  54.43 
 
 
320 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  54.43 
 
 
320 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  54.43 
 
 
320 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1991  thioredoxin-disulfide reductase  54.43 
 
 
320 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  53.23 
 
 
320 aa  344  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  54.43 
 
 
320 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2621  thioredoxin-disulfide reductase  54.43 
 
 
320 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105399  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  52.52 
 
 
318 aa  344  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  55.7 
 
 
318 aa  344  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  54.43 
 
 
320 aa  344  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  59.93 
 
 
329 aa  344  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>