More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1780 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  100 
 
 		 323 aa  671    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  71.52 
 
 		 320 aa  481  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  68.04 
 
 		 315 aa  449  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  67.94 
 
 		 322 aa  449  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  67.21 
 
 		 314 aa  439  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  66.77 
 
 		 326 aa  437  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  68.06 
 
 		 327 aa  432  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  65.4 
 
 		 313 aa  417  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  64.97 
 
 		 315 aa  408  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0199  thioredoxin reductase  63.41 
 
 		 315 aa  402  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  58.15 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1134  thioredoxin reductase  57.37 
 
 		 313 aa  370  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.788555 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  57.05 
 
 		 314 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  53.55 
 
 		 314 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  53.23 
 
 		 314 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  51.78 
 
 		 319 aa  348  7e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  53.35 
 
 		 323 aa  342  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  53.35 
 
 		 323 aa  342  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  54.72 
 
 		 311 aa  342  5.999999999999999e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  52.77 
 
 		 311 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  51.84 
 
 		 324 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  52.92 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  49.07 
 
 		 322 aa  336  3.9999999999999995e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  53.42 
 
 		 317 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2342  thioredoxin reductase oxidoreductase protein  54.37 
 
 		 318 aa  334  9e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0023  thioredoxin reductase  53.25 
 
 		 316 aa  334  9e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  53.48 
 
 		 319 aa  334  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  51.75 
 
 		 311 aa  334  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  51.42 
 
 		 319 aa  333  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  53.55 
 
 		 314 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  53.95 
 
 		 311 aa  330  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  52.05 
 
 		 316 aa  331  1e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  50.48 
 
 		 361 aa  330  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  50.92 
 
 		 319 aa  330  1e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  52.26 
 
 		 332 aa  331  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  52.05 
 
 		 316 aa  330  2e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2601  thioredoxin reductase  52.01 
 
 		 321 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  53.11 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0684  thioredoxin reductase  51.54 
 
 		 317 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00860267  normal  0.703249 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1037  thioredoxin reductase  52.29 
 
 		 333 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.526099 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  53.46 
 
 		 317 aa  329  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00892  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  54.23 
 
 		 321 aa  329  4e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  54.23 
 
 		 321 aa  329  4e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  54.23 
 
 		 321 aa  329  4e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  54.23 
 
 		 321 aa  329  4e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  51.57 
 
 		 320 aa  329  4e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1050  thioredoxin reductase  54.23 
 
 		 321 aa  329  4e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000235297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  51.83 
 
 		 333 aa  329  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  53.92 
 
 		 321 aa  329  4e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  54.23 
 
 		 321 aa  329  4e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  54.23 
 
 		 321 aa  329  4e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2441  thioredoxin reductase  54.23 
 
 		 321 aa  328  7e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000126981  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0791  thioredoxin reductase  51.57 
 
 		 321 aa  327  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5364  thioredoxin reductase  52.2 
 
 		 337 aa  328  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2557  thioredoxin reductase  52.32 
 
 		 318 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3383  thioredoxin reductase  53.14 
 
 		 317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  52.98 
 
 		 322 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  51.43 
 
 		 326 aa  327  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1072  thioredoxin reductase  52.98 
 
 		 322 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00976208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1982  thioredoxin reductase  50.76 
 
 		 328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.343784  normal  0.438815 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  51.92 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2153  thioredoxin reductase  52.32 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.969122  normal  0.900366 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0703  thioredoxin reductase  51.57 
 
 		 321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  51.75 
 
 		 352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  51.92 
 
 		 312 aa  326  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1023  thioredoxin reductase  52.66 
 
 		 322 aa  325  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00170984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1057  thioredoxin reductase  52.66 
 
 		 322 aa  325  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00951777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0963  thioredoxin reductase  52.66 
 
 		 322 aa  325  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000679645  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  50.77 
 
 		 319 aa  326  4.0000000000000003e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  52.22 
 
 		 314 aa  326  4.0000000000000003e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  51.89 
 
 		 346 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  52.94 
 
 		 316 aa  325  5e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  52.96 
 
 		 318 aa  325  5e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  52.73 
 
 		 348 aa  325  5e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  54.6 
 
 		 325 aa  325  5e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  51.55 
 
 		 320 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  51.55 
 
 		 320 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  51.89 
 
 		 320 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  51.55 
 
 		 320 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  50.47 
 
 		 324 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3179  thioredoxin reductase  53.46 
 
 		 316 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  49.84 
 
 		 331 aa  324  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  52.63 
 
 		 316 aa  323  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  52.1 
 
 		 456 aa  323  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1932  thioredoxin reductase  51.72 
 
 		 323 aa  324  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  47.24 
 
 		 323 aa  324  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  52.37 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  51.24 
 
 		 320 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  50 
 
 		 460 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1412  thioredoxin reductase  52.04 
 
 		 322 aa  322  4e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00718409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  51.61 
 
 		 314 aa  322  4e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  50.31 
 
 		 325 aa  322  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  51.86 
 
 		 320 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  51.86 
 
 		 320 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  51.86 
 
 		 320 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1991  thioredoxin-disulfide reductase  51.86 
 
 		 320 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  50.32 
 
 		 335 aa  322  5e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  51.86 
 
 		 320 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2621  thioredoxin-disulfide reductase  51.86 
 
 		 320 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105399  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3045  thioredoxin-disulfide reductase  51.86 
 
 		 320 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>