More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0086 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  100 
 
 
320 aa  660    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  71.52 
 
 
323 aa  481  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  70.1 
 
 
315 aa  461  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  67.83 
 
 
322 aa  448  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  66.34 
 
 
314 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  66.34 
 
 
327 aa  432  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  63.23 
 
 
326 aa  415  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  64.17 
 
 
315 aa  409  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0199  thioredoxin reductase  64.19 
 
 
315 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  63.23 
 
 
313 aa  407  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  58.44 
 
 
334 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1134  thioredoxin reductase  58.06 
 
 
313 aa  364  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.788555 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  56.35 
 
 
319 aa  361  8e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  57.1 
 
 
314 aa  348  5e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  53.11 
 
 
332 aa  333  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  52.04 
 
 
319 aa  333  3e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  54.07 
 
 
314 aa  332  4e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  54.07 
 
 
314 aa  332  4e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  52.43 
 
 
322 aa  332  6e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  53.14 
 
 
460 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  52.26 
 
 
332 aa  328  5.0000000000000004e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  54.63 
 
 
325 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  52.77 
 
 
310 aa  326  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  52.29 
 
 
345 aa  325  9e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  50.81 
 
 
311 aa  324  1e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  52.84 
 
 
311 aa  323  2e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  51.78 
 
 
336 aa  323  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  49.36 
 
 
323 aa  322  4e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  51.79 
 
 
323 aa  322  6e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  51.79 
 
 
323 aa  322  6e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  52.41 
 
 
313 aa  322  7e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  51.79 
 
 
311 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  52.84 
 
 
311 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  53.04 
 
 
456 aa  320  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  51.83 
 
 
333 aa  319  3e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  51.51 
 
 
311 aa  320  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  51.14 
 
 
317 aa  319  5e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  51.14 
 
 
312 aa  318  6e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  51.48 
 
 
340 aa  318  7e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  54.72 
 
 
314 aa  318  7e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  51.26 
 
 
320 aa  318  9e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  51.14 
 
 
311 aa  318  1e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  50.8 
 
 
331 aa  318  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  51.8 
 
 
310 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  54.15 
 
 
314 aa  316  3e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  49.37 
 
 
321 aa  316  3e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  50.5 
 
 
333 aa  315  5e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  49.5 
 
 
353 aa  315  5e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
331 aa  315  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  50 
 
 
334 aa  315  7e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  51.45 
 
 
453 aa  314  9.999999999999999e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  50.5 
 
 
321 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01260  thioredoxin-disulfide reductase, putative  51.1 
 
 
371 aa  311  9e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2342  thioredoxin reductase oxidoreductase protein  52.04 
 
 
318 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  50 
 
 
335 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
335 aa  309  5e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  48.21 
 
 
311 aa  308  5.9999999999999995e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  49.83 
 
 
321 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  49.03 
 
 
330 aa  308  6.999999999999999e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  53.18 
 
 
314 aa  308  6.999999999999999e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  50.98 
 
 
319 aa  308  8e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  49.69 
 
 
319 aa  308  9e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  50.64 
 
 
324 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  48.24 
 
 
324 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2208  thioredoxin reductase  51.47 
 
 
338 aa  308  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1982  thioredoxin reductase  50.8 
 
 
328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.343784  normal  0.438815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  48.71 
 
 
310 aa  306  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  50.17 
 
 
321 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  49.18 
 
 
311 aa  305  6e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  50 
 
 
324 aa  305  7e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  49.03 
 
 
310 aa  305  7e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  49.36 
 
 
321 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  48.23 
 
 
326 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  48.57 
 
 
320 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  50.65 
 
 
348 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  49.68 
 
 
333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  49.68 
 
 
333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  47.92 
 
 
324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  49.68 
 
 
333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  47.57 
 
 
346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1932  thioredoxin reductase  50.96 
 
 
323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  50.33 
 
 
361 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  49.52 
 
 
321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  51.5 
 
 
321 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  49.2 
 
 
338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  48.58 
 
 
324 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  49.03 
 
 
325 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  50.63 
 
 
334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0623  thioredoxin reductase  53.27 
 
 
459 aa  303  3.0000000000000004e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66148  normal  0.453769 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  50.65 
 
 
352 aa  302  5.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  51.78 
 
 
325 aa  302  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  50.96 
 
 
317 aa  302  6.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  48.84 
 
 
330 aa  302  6.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0563  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
326 aa  301  9e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0552475  normal  0.0148693 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03581  Thioredoxin reductase (EC 1.8.1.9) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q08GE2]  51.41 
 
 
339 aa  301  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.813979  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  49.51 
 
 
314 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  48.83 
 
 
330 aa  301  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>