More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1134 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1134  thioredoxin reductase  100 
 
 		 313 aa  638    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.788555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  59.62 
 
 		 314 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  58.2 
 
 		 327 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  57.37 
 
 		 323 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  59.09 
 
 		 313 aa  370  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0199  thioredoxin reductase  58.12 
 
 		 315 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  57.37 
 
 		 322 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  58.06 
 
 		 320 aa  364  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  54.93 
 
 		 315 aa  355  5.999999999999999e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  55.1 
 
 		 326 aa  354  1e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  54.84 
 
 		 334 aa  351  8e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  55.37 
 
 		 315 aa  351  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  53.21 
 
 		 314 aa  342  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  54.87 
 
 		 319 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  53.21 
 
 		 314 aa  342  4e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  54.17 
 
 		 314 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  53.53 
 
 		 314 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  52.73 
 
 		 323 aa  324  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  52.73 
 
 		 323 aa  324  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  52.98 
 
 		 311 aa  323  3e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  53.31 
 
 		 311 aa  322  5e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  50.48 
 
 		 314 aa  321  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  50.48 
 
 		 319 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  53.8 
 
 		 311 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  51.13 
 
 		 332 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  54.09 
 
 		 316 aa  318  7.999999999999999e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  52.08 
 
 		 460 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  53.31 
 
 		 311 aa  317  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  53.77 
 
 		 316 aa  316  3e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  53.29 
 
 		 318 aa  316  3e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  52.98 
 
 		 311 aa  315  5e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  52.79 
 
 		 324 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  50.49 
 
 		 323 aa  314  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  50.93 
 
 		 317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  50.8 
 
 		 311 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  52.06 
 
 		 320 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  52.06 
 
 		 320 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  52.06 
 
 		 320 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  53.18 
 
 		 458 aa  311  9e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0680  thioredoxin reductase  50.96 
 
 		 457 aa  311  1e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  50.16 
 
 		 324 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  51.44 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  49.84 
 
 		 324 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  52.13 
 
 		 324 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  50.96 
 
 		 320 aa  309  4e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  50.96 
 
 		 320 aa  309  4e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  51.91 
 
 		 319 aa  308  5.9999999999999995e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1412  thioredoxin reductase  52.85 
 
 		 322 aa  308  5.9999999999999995e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00718409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  53.16 
 
 		 318 aa  308  6.999999999999999e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  50.16 
 
 		 321 aa  308  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  51.44 
 
 		 316 aa  308  9e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  49.06 
 
 		 324 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  52.13 
 
 		 324 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  50 
 
 		 324 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28227  predicted protein  51.43 
 
 		 547 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0120159 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  51.43 
 
 		 323 aa  306  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  51.11 
 
 		 319 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  51.75 
 
 		 321 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  51.78 
 
 		 345 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2028  thioredoxin reductase  50.16 
 
 		 316 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102058  hitchhiker  0.0000262597 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  52.53 
 
 		 319 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  50.8 
 
 		 314 aa  305  6e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  51.27 
 
 		 316 aa  305  7e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  51.27 
 
 		 321 aa  305  7e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  51.1 
 
 		 319 aa  305  7e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  50 
 
 		 456 aa  305  9.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  51.16 
 
 		 311 aa  305  9.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00892  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  51.43 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  51.43 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  51.43 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1050  thioredoxin reductase  51.43 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000235297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  52.77 
 
 		 335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  49.68 
 
 		 320 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  51.43 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  51.75 
 
 		 322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  51.43 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  51.43 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  52.43 
 
 		 361 aa  304  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1932  thioredoxin reductase  50 
 
 		 317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2486  thioredoxin reductase  50.48 
 
 		 318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000100803  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  50.48 
 
 		 317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1072  thioredoxin reductase  51.75 
 
 		 322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00976208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2441  thioredoxin reductase  51.43 
 
 		 321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000126981  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01037  thioredoxin-disulfide reductase  50.79 
 
 		 322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.088167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06129  thioredoxin-disulfide reductase  50.79 
 
 		 322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345376  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  49.84 
 
 		 321 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1959  thioredoxin reductase  50.16 
 
 		 317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000155114  normal  0.552411 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  50 
 
 		 319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2017  thioredoxin reductase  50.16 
 
 		 317 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000213161  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  50.16 
 
 		 317 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000827938  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  50.32 
 
 		 318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  50.16 
 
 		 317 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0963  thioredoxin reductase  51.43 
 
 		 322 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000679645  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1023  thioredoxin reductase  51.43 
 
 		 322 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00170984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1057  thioredoxin reductase  51.43 
 
 		 322 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00951777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  50.96 
 
 		 314 aa  301  6.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  50.96 
 
 		 461 aa  302  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  50.96 
 
 		 461 aa  302  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  51.46 
 
 		 314 aa  301  7.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  49.04 
 
 		 310 aa  301  8.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>