More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0097 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  100 
 
 		 320 aa  653    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  95.62 
 
 		 320 aa  610  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  78.55 
 
 		 318 aa  502  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  70.19 
 
 		 316 aa  458  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  61.17 
 
 		 334 aa  384  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  58.5 
 
 		 319 aa  364  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  57.98 
 
 		 319 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  57.53 
 
 		 332 aa  354  1e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  55.56 
 
 		 321 aa  352  5e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  59.62 
 
 		 325 aa  350  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  57.19 
 
 		 321 aa  348  6e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  57.57 
 
 		 310 aa  348  7e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  57.19 
 
 		 314 aa  345  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  55.41 
 
 		 321 aa  345  4e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  57.19 
 
 		 314 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  55.97 
 
 		 348 aa  342  5e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  52.4 
 
 		 322 aa  340  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  56.72 
 
 		 314 aa  339  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  57 
 
 		 321 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  56.35 
 
 		 321 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  55.56 
 
 		 330 aa  336  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  52.85 
 
 		 321 aa  335  5e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  55.08 
 
 		 310 aa  334  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  55.05 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  53.9 
 
 		 335 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  54.3 
 
 		 310 aa  332  4e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  54.33 
 
 		 311 aa  332  6e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  52.72 
 
 		 317 aa  332  6e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  55.66 
 
 		 321 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  54.25 
 
 		 312 aa  331  8e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  54.25 
 
 		 317 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  51.42 
 
 		 345 aa  330  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  52.58 
 
 		 316 aa  329  4e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  55.7 
 
 		 321 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  53.92 
 
 		 314 aa  329  4e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  52.26 
 
 		 316 aa  328  5.0000000000000004e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  55.17 
 
 		 346 aa  329  5.0000000000000004e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  54.33 
 
 		 311 aa  328  5.0000000000000004e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  55.33 
 
 		 311 aa  328  6e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  54.92 
 
 		 332 aa  328  6e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  54.19 
 
 		 335 aa  327  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  57.19 
 
 		 314 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  54.25 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  53.23 
 
 		 326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  55.21 
 
 		 320 aa  326  3e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  52.33 
 
 		 311 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  50.64 
 
 		 361 aa  325  5e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  50 
 
 		 323 aa  325  6e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  53 
 
 		 311 aa  325  6e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  55.63 
 
 		 336 aa  325  7e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  52.08 
 
 		 352 aa  325  8.000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  54.43 
 
 		 313 aa  324  1e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  52.19 
 
 		 324 aa  324  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  53.44 
 
 		 353 aa  324  1e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  56.91 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  53.23 
 
 		 324 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  54.33 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  52.58 
 
 		 314 aa  322  4e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  55.88 
 
 		 314 aa  322  5e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  52.53 
 
 		 326 aa  322  6e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  52.77 
 
 		 314 aa  321  9.000000000000001e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  53.75 
 
 		 320 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  51.88 
 
 		 324 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0563  thioredoxin reductase  54.4 
 
 		 326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0552475  normal  0.0148693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  53.23 
 
 		 331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  50.32 
 
 		 319 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  54.75 
 
 		 312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  55.05 
 
 		 325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  53 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  53.31 
 
 		 333 aa  320  3e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  51.88 
 
 		 324 aa  320  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  51.67 
 
 		 334 aa  320  3e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  51.12 
 
 		 317 aa  319  3.9999999999999996e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  50.78 
 
 		 324 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  55.38 
 
 		 362 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  52.82 
 
 		 340 aa  318  5e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  50 
 
 		 333 aa  318  6e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  54.15 
 
 		 333 aa  318  6e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  49.19 
 
 		 331 aa  318  6e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  54.15 
 
 		 333 aa  318  6e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  54.15 
 
 		 333 aa  318  6e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  53.16 
 
 		 326 aa  318  7e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2208  thioredoxin reductase  52.63 
 
 		 338 aa  318  7.999999999999999e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  52.58 
 
 		 320 aa  317  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  51.94 
 
 		 324 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  54.37 
 
 		 314 aa  318  1e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  49.37 
 
 		 320 aa  317  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0331  thioredoxin reductase  49.36 
 
 		 321 aa  317  2e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  50.33 
 
 		 310 aa  317  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  55.66 
 
 		 317 aa  316  4e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  51.94 
 
 		 330 aa  316  4e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  52.56 
 
 		 333 aa  316  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  50.96 
 
 		 338 aa  316  4e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  56.03 
 
 		 317 aa  315  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  53.38 
 
 		 323 aa  315  7e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  52 
 
 		 311 aa  315  8e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2342  thioredoxin reductase oxidoreductase protein  52.53 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  52.41 
 
 		 321 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  51.29 
 
 		 324 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  49.37 
 
 		 320 aa  313  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>