More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1778 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 		 315 aa  651    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  72.26 
 
 		 322 aa  467  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  70.1 
 
 		 320 aa  461  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  68.04 
 
 		 323 aa  449  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  69.03 
 
 		 327 aa  437  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  66.78 
 
 		 314 aa  439  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0199  thioredoxin reductase  68.05 
 
 		 315 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  67.41 
 
 		 313 aa  422  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  64.52 
 
 		 326 aa  417  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  61.64 
 
 		 315 aa  404  1e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  57.1 
 
 		 334 aa  386  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1134  thioredoxin reductase  55.37 
 
 		 313 aa  351  1e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.788555 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  54.63 
 
 		 314 aa  344  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  53 
 
 		 311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  53.31 
 
 		 314 aa  335  7e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  53.31 
 
 		 314 aa  335  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  52.12 
 
 		 348 aa  334  9e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  51.46 
 
 		 332 aa  334  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  51.77 
 
 		 319 aa  334  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  56.58 
 
 		 325 aa  332  5e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  54.13 
 
 		 345 aa  332  5e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  52.96 
 
 		 319 aa  330  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  53.33 
 
 		 460 aa  328  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  52 
 
 		 311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  52.13 
 
 		 310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  52 
 
 		 311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  50.99 
 
 		 311 aa  325  7e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  51.95 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  53 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  53.07 
 
 		 456 aa  323  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  51.5 
 
 		 333 aa  322  5e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  51.6 
 
 		 319 aa  322  7e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  52.94 
 
 		 332 aa  321  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  50.99 
 
 		 310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  53.97 
 
 		 314 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  49.68 
 
 		 331 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  51.8 
 
 		 348 aa  319  5e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  49.51 
 
 		 322 aa  319  5e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  50.31 
 
 		 324 aa  318  6e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  50.16 
 
 		 320 aa  318  1e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  52.65 
 
 		 314 aa  317  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  48.52 
 
 		 346 aa  317  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  49.84 
 
 		 310 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  49.05 
 
 		 323 aa  316  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  49.05 
 
 		 323 aa  316  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  50.17 
 
 		 340 aa  316  4e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  50.8 
 
 		 453 aa  315  5e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  48.84 
 
 		 331 aa  315  6e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  51.82 
 
 		 331 aa  315  7e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  49.68 
 
 		 336 aa  315  7e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  52.12 
 
 		 335 aa  315  8e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  50.31 
 
 		 324 aa  314  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  54.05 
 
 		 461 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  50.5 
 
 		 323 aa  314  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  54.05 
 
 		 461 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  47.92 
 
 		 330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  49.67 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  51.49 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  51.49 
 
 		 317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  50.32 
 
 		 325 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  50 
 
 		 324 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  49.2 
 
 		 321 aa  312  5.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1664  thioredoxin reductase  51.25 
 
 		 324 aa  311  7.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28715  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  50 
 
 		 321 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  50 
 
 		 333 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  50 
 
 		 333 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  50 
 
 		 333 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_004310  BR1499  thioredoxin reductase  51.56 
 
 		 324 aa  310  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.770592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  47.4 
 
 		 330 aa  310  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  49.53 
 
 		 338 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  51.13 
 
 		 458 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  49.67 
 
 		 330 aa  309  4e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  48.51 
 
 		 310 aa  308  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2342  thioredoxin reductase oxidoreductase protein  50.79 
 
 		 318 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  53.14 
 
 		 344 aa  308  8e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  47.39 
 
 		 359 aa  308  8e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  52.05 
 
 		 334 aa  308  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  49.04 
 
 		 324 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0623  thioredoxin reductase  53.4 
 
 		 459 aa  306  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66148  normal  0.453769 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  50.65 
 
 		 361 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  51.3 
 
 		 314 aa  307  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  47.62 
 
 		 361 aa  306  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0684  thioredoxin reductase  50.31 
 
 		 317 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00860267  normal  0.703249 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  50.33 
 
 		 321 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  49.18 
 
 		 335 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  49.52 
 
 		 324 aa  305  6e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  51.28 
 
 		 325 aa  305  7e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  50.33 
 
 		 326 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  48.73 
 
 		 318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  49.52 
 
 		 324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  49.34 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  49.36 
 
 		 314 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  49.68 
 
 		 317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  49.2 
 
 		 324 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  49.21 
 
 		 321 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1119  thioredoxin reductase  49.84 
 
 		 316 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.202817  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2762  thioredoxin-disulfide reductase  49.68 
 
 		 315 aa  302  5.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117857  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1037  thioredoxin reductase  49.22 
 
 		 333 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.526099 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  47.88 
 
 		 353 aa  301  7.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  48.86 
 
 		 333 aa  301  7.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>