More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37940 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
333 aa  673    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  93.66 
 
 
332 aa  633  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  78.14 
 
 
340 aa  520  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  77.6 
 
 
313 aa  499  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  76.75 
 
 
330 aa  488  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  71.66 
 
 
346 aa  454  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  67.9 
 
 
359 aa  451  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  75.24 
 
 
344 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  66.46 
 
 
353 aa  450  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  76.64 
 
 
327 aa  440  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  71.38 
 
 
329 aa  433  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  65.29 
 
 
318 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  69.41 
 
 
319 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  69.74 
 
 
310 aa  428  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  64.54 
 
 
318 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  69.3 
 
 
325 aa  421  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  67.1 
 
 
310 aa  419  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  64.86 
 
 
348 aa  414  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  67.33 
 
 
310 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  69.41 
 
 
309 aa  409  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  68.18 
 
 
317 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  67.2 
 
 
329 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  61.01 
 
 
333 aa  399  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  64.42 
 
 
336 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  67.99 
 
 
348 aa  397  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  65.58 
 
 
361 aa  395  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  60.96 
 
 
331 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  62.66 
 
 
330 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  61.98 
 
 
333 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  61.98 
 
 
333 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  61.98 
 
 
333 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  62.3 
 
 
310 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  63.25 
 
 
330 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  59.94 
 
 
335 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  61.86 
 
 
327 aa  375  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  63.93 
 
 
331 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  59.94 
 
 
325 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  58.88 
 
 
313 aa  367  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  64.22 
 
 
317 aa  359  4e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  63.9 
 
 
362 aa  358  7e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  58.84 
 
 
318 aa  358  7e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  62.91 
 
 
325 aa  357  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  53.61 
 
 
334 aa  342  4e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  57.28 
 
 
319 aa  340  1e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  54.14 
 
 
334 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  56.65 
 
 
320 aa  333  2e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  50.3 
 
 
339 aa  332  7.000000000000001e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  57.98 
 
 
325 aa  329  4e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  51.5 
 
 
315 aa  322  5e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  54.91 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  53.47 
 
 
332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  53.31 
 
 
320 aa  320  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  51.83 
 
 
320 aa  319  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  53.97 
 
 
311 aa  319  5e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  54.87 
 
 
321 aa  318  7e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  52.61 
 
 
311 aa  317  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  54.37 
 
 
314 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  54.37 
 
 
314 aa  316  3e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  50.64 
 
 
322 aa  315  7e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  52.23 
 
 
345 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  51.82 
 
 
311 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  50.83 
 
 
311 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  53.25 
 
 
321 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  51.74 
 
 
331 aa  311  9e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  49.68 
 
 
314 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  50.65 
 
 
311 aa  309  4e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  49.67 
 
 
314 aa  308  6.999999999999999e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  52.27 
 
 
321 aa  308  8e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  54.28 
 
 
317 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  54.19 
 
 
321 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  54.28 
 
 
312 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  50.17 
 
 
311 aa  306  3e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  50.96 
 
 
316 aa  306  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1360  thioredoxin reductase  52.09 
 
 
332 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  52.46 
 
 
335 aa  305  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  50.81 
 
 
311 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  53.8 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  54.43 
 
 
321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  54.37 
 
 
314 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
361 aa  302  4.0000000000000003e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  52.61 
 
 
313 aa  302  7.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  53.07 
 
 
321 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  50.65 
 
 
324 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  52.63 
 
 
318 aa  301  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  49.68 
 
 
460 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
456 aa  300  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  47.62 
 
 
326 aa  300  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  49.52 
 
 
319 aa  300  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
324 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  53 
 
 
320 aa  299  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  47.1 
 
 
323 aa  299  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  48.88 
 
 
320 aa  298  1e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  48.88 
 
 
320 aa  298  1e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  53.42 
 
 
314 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
321 aa  297  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1932  thioredoxin reductase  49.69 
 
 
323 aa  296  5e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  51.8 
 
 
321 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  48.73 
 
 
352 aa  295  5e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  49.36 
 
 
316 aa  295  6e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  48.87 
 
 
316 aa  295  6e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>