More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5401 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  100 
 
 		 361 aa  728    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  68.14 
 
 		 331 aa  434  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  66.25 
 
 		 336 aa  431  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  65.33 
 
 		 333 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  65.33 
 
 		 333 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  65.33 
 
 		 333 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  66.98 
 
 		 335 aa  427  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  65.4 
 
 		 330 aa  421  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  67.3 
 
 		 330 aa  424  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  66.67 
 
 		 331 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  66.24 
 
 		 313 aa  408  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  67.96 
 
 		 340 aa  402  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  62.94 
 
 		 318 aa  399  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  65.58 
 
 		 333 aa  395  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  66.23 
 
 		 332 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  62.05 
 
 		 346 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  63.17 
 
 		 348 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  64.19 
 
 		 330 aa  385  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  62.26 
 
 		 310 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  63.96 
 
 		 310 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  62.58 
 
 		 319 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  62.38 
 
 		 359 aa  385  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  64.82 
 
 		 325 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  64.24 
 
 		 348 aa  378  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  62.05 
 
 		 344 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  61.89 
 
 		 310 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  60 
 
 		 310 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  64.08 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  57.59 
 
 		 353 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  64.44 
 
 		 329 aa  368  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  61.95 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  57.01 
 
 		 318 aa  364  1e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  61.61 
 
 		 309 aa  359  4e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  57.74 
 
 		 318 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  59.94 
 
 		 329 aa  353  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  55.7 
 
 		 332 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  62.58 
 
 		 317 aa  347  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  59.18 
 
 		 317 aa  346  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  55.56 
 
 		 333 aa  344  1e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  61.99 
 
 		 362 aa  344  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  55.16 
 
 		 319 aa  340  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  53.63 
 
 		 313 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  53.04 
 
 		 311 aa  335  9e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  53.99 
 
 		 311 aa  335  9e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  64.82 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  53.21 
 
 		 334 aa  331  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  52.26 
 
 		 311 aa  331  2e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  55.59 
 
 		 325 aa  329  4e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  53.38 
 
 		 311 aa  328  7e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  51.44 
 
 		 311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  52.72 
 
 		 311 aa  325  7e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  51.47 
 
 		 314 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  51.47 
 
 		 314 aa  322  5e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  52.58 
 
 		 311 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  52.61 
 
 		 325 aa  318  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  53.56 
 
 		 320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  52.24 
 
 		 325 aa  309  5e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  51.14 
 
 		 314 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  47.62 
 
 		 315 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  50.15 
 
 		 339 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  49.19 
 
 		 334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0199  thioredoxin reductase  46.93 
 
 		 315 aa  303  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  48.89 
 
 		 456 aa  301  9e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  46.67 
 
 		 314 aa  301  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  47.3 
 
 		 460 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  49.34 
 
 		 320 aa  300  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  49.35 
 
 		 313 aa  298  8e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  46.01 
 
 		 326 aa  298  1e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  47.28 
 
 		 311 aa  296  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  48.56 
 
 		 322 aa  296  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  46.84 
 
 		 323 aa  296  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  46.77 
 
 		 319 aa  293  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  48.25 
 
 		 324 aa  291  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  48.21 
 
 		 320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  47.23 
 
 		 317 aa  288  7e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3383  thioredoxin reductase  47.23 
 
 		 317 aa  288  9e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  51.44 
 
 		 320 aa  287  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0634  thioredoxin reductase  46.18 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  48.53 
 
 		 320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  47.48 
 
 		 461 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  47.48 
 
 		 461 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  48.88 
 
 		 314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  48.54 
 
 		 320 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  47.77 
 
 		 324 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  47.56 
 
 		 335 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1118  thioredoxin reductase  47.56 
 
 		 316 aa  285  7e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  46.15 
 
 		 333 aa  285  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  46.47 
 
 		 314 aa  285  8e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  47.32 
 
 		 361 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  46.08 
 
 		 316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  48.41 
 
 		 458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  48.55 
 
 		 321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  47.56 
 
 		 315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  46.31 
 
 		 333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  46.3 
 
 		 320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  46.3 
 
 		 320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  49.2 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  51.3 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  48.54 
 
 		 316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  46.3 
 
 		 320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>