More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4212 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  100 
 
 
344 aa  690    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  75.24 
 
 
333 aa  474  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  73.09 
 
 
332 aa  474  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  72.82 
 
 
359 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  70.98 
 
 
340 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  69.21 
 
 
346 aa  464  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  73.79 
 
 
330 aa  464  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  69.55 
 
 
313 aa  458  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  69.77 
 
 
353 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  74.92 
 
 
325 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  73.97 
 
 
329 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  68.17 
 
 
319 aa  442  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  66.98 
 
 
348 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  70.39 
 
 
310 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  69.03 
 
 
310 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  70.13 
 
 
317 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  67.21 
 
 
310 aa  428  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  72.17 
 
 
327 aa  422  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  64.42 
 
 
333 aa  422  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  66.01 
 
 
318 aa  421  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  69.45 
 
 
329 aa  424  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  70.78 
 
 
348 aa  418  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  65.26 
 
 
318 aa  418  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  69.93 
 
 
309 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  63.64 
 
 
310 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  63.46 
 
 
330 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  64.04 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  62.05 
 
 
361 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  61.7 
 
 
331 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  63.26 
 
 
335 aa  389  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  62.86 
 
 
333 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  62.86 
 
 
333 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  62.86 
 
 
333 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  65.13 
 
 
327 aa  386  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  61.94 
 
 
330 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  66.45 
 
 
325 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  65.18 
 
 
317 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  61.29 
 
 
331 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  65.18 
 
 
362 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  56.82 
 
 
313 aa  367  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  57.61 
 
 
318 aa  355  7.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  57.14 
 
 
325 aa  353  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  59.47 
 
 
314 aa  350  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  59.14 
 
 
314 aa  349  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  60.59 
 
 
325 aa  346  4e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  54.72 
 
 
311 aa  343  2e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  57.57 
 
 
319 aa  342  5e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  56.62 
 
 
332 aa  338  5e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  54.34 
 
 
311 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  59.14 
 
 
314 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  53.38 
 
 
311 aa  335  9e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  52.92 
 
 
334 aa  334  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  53.09 
 
 
311 aa  333  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  52.26 
 
 
311 aa  332  6e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  53.25 
 
 
311 aa  329  4e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  49.55 
 
 
339 aa  329  4e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  53.31 
 
 
315 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  53.29 
 
 
321 aa  326  3e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  54.66 
 
 
320 aa  324  2e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  50.97 
 
 
311 aa  324  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  52.88 
 
 
321 aa  324  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  51.26 
 
 
320 aa  322  8e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  55.19 
 
 
325 aa  322  8e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  54.28 
 
 
321 aa  322  8e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  55.88 
 
 
314 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  51.94 
 
 
456 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  50.48 
 
 
323 aa  320  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  49.27 
 
 
460 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  51.61 
 
 
334 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  49.05 
 
 
326 aa  318  7e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  53.44 
 
 
345 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  52.42 
 
 
333 aa  316  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  53.92 
 
 
326 aa  316  4e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  50.33 
 
 
320 aa  315  6e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  52.94 
 
 
331 aa  315  6e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  53.97 
 
 
320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  50 
 
 
322 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  51.57 
 
 
324 aa  311  9e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
314 aa  311  9e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  54.61 
 
 
312 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  54.61 
 
 
317 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  49.36 
 
 
317 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1360  thioredoxin reductase  52.26 
 
 
332 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  51.26 
 
 
324 aa  310  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  49.52 
 
 
453 aa  309  4e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  52.19 
 
 
325 aa  309  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2289  thioredoxin reductase  49.38 
 
 
320 aa  309  4e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  53.92 
 
 
321 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  52.41 
 
 
313 aa  308  6.999999999999999e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  50.94 
 
 
324 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  53.67 
 
 
321 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1633  thioredoxin reductase  49.56 
 
 
349 aa  306  3e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  51.44 
 
 
361 aa  306  3e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  48.29 
 
 
319 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  51.56 
 
 
316 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  49.34 
 
 
327 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1932  thioredoxin reductase  50.79 
 
 
323 aa  305  6e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0978  thioredoxin reductase  53.57 
 
 
315 aa  305  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.993828  normal  0.0140705 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01037  thioredoxin-disulfide reductase  51.12 
 
 
322 aa  305  7e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.088167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06129  thioredoxin-disulfide reductase  51.12 
 
 
322 aa  305  7e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>