More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3717 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  100 
 
 		 340 aa  682    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  78.14 
 
 		 333 aa  520  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  80.7 
 
 		 332 aa  520  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  75.78 
 
 		 330 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  72.5 
 
 		 313 aa  485  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  80.25 
 
 		 327 aa  484  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  73.08 
 
 		 346 aa  471  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  71.99 
 
 		 359 aa  457  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  74.43 
 
 		 325 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  70.98 
 
 		 344 aa  449  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  71.57 
 
 		 319 aa  451  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  66.77 
 
 		 353 aa  449  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  73.4 
 
 		 329 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  68.52 
 
 		 310 aa  436  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  69.61 
 
 		 310 aa  435  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  67.85 
 
 		 348 aa  434  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  68.51 
 
 		 317 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  67.96 
 
 		 310 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  64.42 
 
 		 318 aa  423  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  70.92 
 
 		 309 aa  423  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  64.13 
 
 		 318 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  68.85 
 
 		 348 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  69.48 
 
 		 329 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  61.04 
 
 		 333 aa  403  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  67.96 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  63.31 
 
 		 310 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  63.55 
 
 		 330 aa  393  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  64.29 
 
 		 333 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  64.29 
 
 		 333 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  65.13 
 
 		 327 aa  389  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  64.29 
 
 		 333 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  62.99 
 
 		 331 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  63.75 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  61.86 
 
 		 330 aa  383  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  60.78 
 
 		 313 aa  384  1e-105  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  62.62 
 
 		 325 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  59.54 
 
 		 325 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  60.83 
 
 		 335 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  62.21 
 
 		 331 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  64.74 
 
 		 317 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  64.42 
 
 		 362 aa  361  1e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  59.8 
 
 		 318 aa  360  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  57.7 
 
 		 319 aa  350  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  57.1 
 
 		 320 aa  340  2e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  57.19 
 
 		 325 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  51.2 
 
 		 339 aa  333  2e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  55.15 
 
 		 334 aa  332  5e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  52.61 
 
 		 311 aa  329  4e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  53.62 
 
 		 311 aa  328  7e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  52.1 
 
 		 311 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  52.98 
 
 		 334 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  51.64 
 
 		 311 aa  325  5e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  53.11 
 
 		 311 aa  325  8.000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  52.43 
 
 		 311 aa  325  9e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  53.38 
 
 		 321 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  52.73 
 
 		 321 aa  319  3e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  51.8 
 
 		 322 aa  319  6e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  52.82 
 
 		 320 aa  318  6e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  51.48 
 
 		 320 aa  318  7e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  54.61 
 
 		 321 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  50.65 
 
 		 311 aa  317  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  54.13 
 
 		 318 aa  316  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  50.17 
 
 		 315 aa  316  4e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  50.78 
 
 		 332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  49.38 
 
 		 319 aa  312  5.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  54.15 
 
 		 314 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  52.46 
 
 		 317 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  52.46 
 
 		 312 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  52.9 
 
 		 325 aa  310  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  54.15 
 
 		 314 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  48.62 
 
 		 361 aa  308  5.9999999999999995e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  49.5 
 
 		 314 aa  308  8e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  51.13 
 
 		 456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  51.13 
 
 		 323 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  52.3 
 
 		 345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  51.64 
 
 		 335 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  53.21 
 
 		 321 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  51.97 
 
 		 321 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0375  thioredoxin reductase  52.61 
 
 		 312 aa  305  8.000000000000001e-82  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  48.24 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  53.7 
 
 		 321 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  49.52 
 
 		 324 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  53.77 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  49.04 
 
 		 461 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  49.04 
 
 		 461 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  49.67 
 
 		 314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  52.88 
 
 		 321 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  49.34 
 
 		 316 aa  303  4.0000000000000003e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0680  thioredoxin reductase  49.68 
 
 		 457 aa  302  5.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  50.97 
 
 		 458 aa  302  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  48.22 
 
 		 326 aa  302  7.000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  52.96 
 
 		 321 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  50.48 
 
 		 333 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  52.49 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  50.16 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  50 
 
 		 352 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  49.21 
 
 		 324 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  54.15 
 
 		 314 aa  298  7e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01037  thioredoxin-disulfide reductase  50 
 
 		 322 aa  298  8e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.088167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06129  thioredoxin-disulfide reductase  50 
 
 		 322 aa  298  8e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>