More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5084 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  100 
 
 		 325 aa  659    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  71.95 
 
 		 319 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  70 
 
 		 348 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  69.31 
 
 		 310 aa  434  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  69.26 
 
 		 348 aa  429  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  69.87 
 
 		 310 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  68.87 
 
 		 330 aa  423  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  69.08 
 
 		 336 aa  423  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  70.45 
 
 		 327 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  71.62 
 
 		 309 aa  421  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  68.21 
 
 		 331 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  68.32 
 
 		 310 aa  411  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  67.22 
 
 		 333 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  67.22 
 
 		 333 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  65.68 
 
 		 331 aa  408  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  67.22 
 
 		 333 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  65.23 
 
 		 330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  65.79 
 
 		 346 aa  402  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  64.57 
 
 		 310 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  64.82 
 
 		 361 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  62.62 
 
 		 340 aa  394  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  62.94 
 
 		 335 aa  391  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  61.94 
 
 		 359 aa  386  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  65.82 
 
 		 317 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  64.24 
 
 		 332 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  66.14 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  62.79 
 
 		 313 aa  379  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  61.92 
 
 		 318 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  67.77 
 
 		 329 aa  378  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  64.01 
 
 		 330 aa  381  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  66.45 
 
 		 344 aa  376  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  62.42 
 
 		 333 aa  376  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  66.11 
 
 		 325 aa  374  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  64.47 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  60.39 
 
 		 353 aa  372  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  64.36 
 
 		 329 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  59.74 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  59.08 
 
 		 311 aa  364  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  57.56 
 
 		 333 aa  362  7.0000000000000005e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  60.47 
 
 		 325 aa  360  1e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  59.87 
 
 		 318 aa  360  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  59.27 
 
 		 319 aa  360  3e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  58.53 
 
 		 314 aa  358  5e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  58.53 
 
 		 314 aa  358  6e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  58.42 
 
 		 311 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  57.24 
 
 		 311 aa  352  4e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  57.24 
 
 		 318 aa  349  4e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  54.9 
 
 		 311 aa  347  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  55.78 
 
 		 311 aa  347  2e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  58.19 
 
 		 314 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  56.11 
 
 		 311 aa  344  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  58.28 
 
 		 332 aa  343  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  56.25 
 
 		 311 aa  342  2.9999999999999997e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  56.59 
 
 		 320 aa  341  1e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  62.9 
 
 		 327 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  56.68 
 
 		 314 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  53.57 
 
 		 319 aa  331  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  54.4 
 
 		 313 aa  326  4.0000000000000003e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  52.27 
 
 		 460 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  49.39 
 
 		 323 aa  320  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  55.74 
 
 		 333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  52.26 
 
 		 456 aa  319  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  51.77 
 
 		 334 aa  319  5e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  52.6 
 
 		 324 aa  317  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  50.17 
 
 		 326 aa  317  3e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  51.1 
 
 		 324 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  52.15 
 
 		 314 aa  316  4e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  49.39 
 
 		 342 aa  315  6e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  53.59 
 
 		 319 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  51.26 
 
 		 458 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  56.25 
 
 		 314 aa  315  9.999999999999999e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_002620  TC0375  thioredoxin reductase  52.44 
 
 		 312 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  49.17 
 
 		 315 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  52.94 
 
 		 319 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  49.67 
 
 		 314 aa  312  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2389  thioredoxin reductase  51.96 
 
 		 316 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0722352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  51.96 
 
 		 316 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  50.47 
 
 		 324 aa  311  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  53.36 
 
 		 315 aa  311  9e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  51.78 
 
 		 461 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  51.78 
 
 		 461 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  51.48 
 
 		 323 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  52.3 
 
 		 325 aa  310  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  51.32 
 
 		 326 aa  310  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  51.48 
 
 		 323 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  50.32 
 
 		 320 aa  309  2.9999999999999997e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  52.3 
 
 		 345 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  50.32 
 
 		 320 aa  309  2.9999999999999997e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  53.33 
 
 		 320 aa  309  4e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  51.47 
 
 		 338 aa  308  5.9999999999999995e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  51.62 
 
 		 314 aa  308  6.999999999999999e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  52.77 
 
 		 318 aa  308  6.999999999999999e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  51.63 
 
 		 316 aa  308  9e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  52.65 
 
 		 321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  50.65 
 
 		 321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  51.8 
 
 		 324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  53.29 
 
 		 325 aa  306  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0199  thioredoxin reductase  49.67 
 
 		 315 aa  306  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  51.48 
 
 		 324 aa  306  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  50.16 
 
 		 316 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>