More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14640 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
332 aa  671    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  93.66 
 
 
333 aa  633  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  80.7 
 
 
340 aa  520  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  78.32 
 
 
330 aa  496  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  75.32 
 
 
313 aa  487  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  73.09 
 
 
344 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  69.62 
 
 
359 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  71.66 
 
 
346 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  66.98 
 
 
353 aa  447  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  77.63 
 
 
327 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  70.03 
 
 
319 aa  437  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  67.53 
 
 
318 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  70.75 
 
 
325 aa  434  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  70.37 
 
 
329 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  66.23 
 
 
318 aa  430  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  69.41 
 
 
310 aa  428  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  66.77 
 
 
310 aa  424  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  68.91 
 
 
317 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  66.45 
 
 
348 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  66.67 
 
 
310 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  69.06 
 
 
309 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  65.27 
 
 
336 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  69.31 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  65.74 
 
 
329 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  62.38 
 
 
333 aa  400  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  61.45 
 
 
331 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  66.23 
 
 
361 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  63.31 
 
 
330 aa  388  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  62.18 
 
 
333 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  62.18 
 
 
333 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  62.18 
 
 
333 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  62.14 
 
 
330 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  62.66 
 
 
310 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  58.52 
 
 
313 aa  371  1e-102  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  59.12 
 
 
325 aa  371  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  59.63 
 
 
335 aa  373  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  62.01 
 
 
331 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  61.94 
 
 
327 aa  372  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  64.86 
 
 
362 aa  365  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  64.24 
 
 
325 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  64.65 
 
 
317 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  59.93 
 
 
318 aa  356  3.9999999999999996e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  59.18 
 
 
320 aa  349  4e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  58.28 
 
 
319 aa  348  5e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  55.48 
 
 
334 aa  347  2e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  55.73 
 
 
334 aa  345  5e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  51.2 
 
 
339 aa  338  8e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  59.34 
 
 
325 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  51.46 
 
 
315 aa  334  1e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  52.26 
 
 
320 aa  328  5.0000000000000004e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  54.58 
 
 
332 aa  328  6e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  54.92 
 
 
320 aa  328  7e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  55.28 
 
 
325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  54.55 
 
 
311 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  55.66 
 
 
314 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  55.66 
 
 
314 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  52.73 
 
 
311 aa  324  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  52.6 
 
 
311 aa  322  5e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  51.62 
 
 
311 aa  320  3e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  53.05 
 
 
321 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  53.44 
 
 
345 aa  318  6e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  54.34 
 
 
321 aa  318  7.999999999999999e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  53.38 
 
 
321 aa  318  7.999999999999999e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  51.13 
 
 
322 aa  316  3e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  50.8 
 
 
311 aa  317  3e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  51.89 
 
 
331 aa  316  4e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  50.83 
 
 
314 aa  315  8e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
319 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  53.95 
 
 
318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  51.43 
 
 
460 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  50 
 
 
311 aa  312  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  55.66 
 
 
314 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  51.28 
 
 
311 aa  311  9e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  48.25 
 
 
326 aa  311  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  54.93 
 
 
312 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  54.93 
 
 
317 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1360  thioredoxin reductase  52.04 
 
 
332 aa  310  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  51.59 
 
 
456 aa  310  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  52.27 
 
 
324 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  54.17 
 
 
321 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  55.05 
 
 
314 aa  308  8e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  51.95 
 
 
324 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  53.18 
 
 
313 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  53.04 
 
 
335 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  53.99 
 
 
320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  53.85 
 
 
321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  50.78 
 
 
361 aa  306  4.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  53.82 
 
 
320 aa  306  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  47.78 
 
 
323 aa  306  5.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1932  thioredoxin reductase  50.47 
 
 
323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  51.64 
 
 
322 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  49.06 
 
 
316 aa  302  5.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  52.08 
 
 
325 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  50 
 
 
316 aa  301  1e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  50 
 
 
316 aa  301  1e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1982  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
328 aa  300  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.343784  normal  0.438815 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1269  thioredoxin reductase  50.49 
 
 
309 aa  300  2e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  53.77 
 
 
321 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0388  putative thioredoxin reductase  48.91 
 
 
340 aa  300  3e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.457738  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0429  thioredoxin reductase  48.62 
 
 
340 aa  300  3e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.749384  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>