More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1512 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  100 
 
 		 321 aa  657    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  91.9 
 
 		 321 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  90.34 
 
 		 321 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  88.47 
 
 		 321 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  86.13 
 
 		 321 aa  570  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  86.45 
 
 		 321 aa  567  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  85.81 
 
 		 321 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  79.67 
 
 		 320 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  70.66 
 
 		 334 aa  474  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  70 
 
 		 325 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  68.35 
 
 		 326 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  68.93 
 
 		 324 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  68.93 
 
 		 324 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  67.61 
 
 		 326 aa  467  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  67.96 
 
 		 324 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  68.47 
 
 		 324 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  70.74 
 
 		 314 aa  454  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  68.94 
 
 		 325 aa  455  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  72.22 
 
 		 335 aa  453  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  67.83 
 
 		 324 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0563  thioredoxin reductase  68.71 
 
 		 326 aa  447  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0552475  normal  0.0148693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  66.25 
 
 		 324 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  67.19 
 
 		 324 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  67.2 
 
 		 317 aa  441  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  67.2 
 
 		 312 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  65.62 
 
 		 345 aa  441  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  64.69 
 
 		 338 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  65.27 
 
 		 335 aa  434  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  64.63 
 
 		 321 aa  435  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  64.31 
 
 		 331 aa  433  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  66.35 
 
 		 332 aa  428  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  64.63 
 
 		 313 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  67.75 
 
 		 314 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1664  thioredoxin reductase  64.4 
 
 		 324 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28715  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1499  thioredoxin reductase  64.69 
 
 		 324 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.770592  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  62.38 
 
 		 322 aa  417  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0981  thioredoxin-disulfide reductase  62.74 
 
 		 317 aa  412  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.708131  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  60.45 
 
 		 323 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  63.64 
 
 		 361 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2208  thioredoxin reductase  67.97 
 
 		 338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  59.55 
 
 		 314 aa  396  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1450  thioredoxin-disulfide reductase  64.38 
 
 		 324 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0331  thioredoxin reductase  58.86 
 
 		 321 aa  379  1e-104  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0735  thioredoxin-disulfide reductase  57.91 
 
 		 318 aa  371  1e-102  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  56.45 
 
 		 316 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  56.13 
 
 		 316 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  55.84 
 
 		 317 aa  358  6e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  56.47 
 
 		 317 aa  358  9e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  56.77 
 
 		 311 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  55.7 
 
 		 311 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0558  thioredoxin-disulfide reductase  55.31 
 
 		 314 aa  355  3.9999999999999996e-97  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  56.45 
 
 		 314 aa  355  7.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  55.21 
 
 		 319 aa  354  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  55.66 
 
 		 320 aa  353  2e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  55.66 
 
 		 320 aa  353  2e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  55.99 
 
 		 314 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  55.84 
 
 		 319 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  55.99 
 
 		 314 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  57.62 
 
 		 311 aa  352  7e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  54.57 
 
 		 317 aa  351  8e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  57.28 
 
 		 311 aa  350  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  55.99 
 
 		 323 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  55.99 
 
 		 323 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  57.1 
 
 		 320 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  56.15 
 
 		 320 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1991  thioredoxin-disulfide reductase  56.15 
 
 		 320 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  56.15 
 
 		 320 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3045  thioredoxin-disulfide reductase  56.15 
 
 		 320 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  56.15 
 
 		 320 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  55.66 
 
 		 320 aa  347  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  56.15 
 
 		 320 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2621  thioredoxin-disulfide reductase  56.15 
 
 		 320 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105399  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  55.52 
 
 		 320 aa  345  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  55.84 
 
 		 320 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  55.84 
 
 		 320 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  55.52 
 
 		 346 aa  345  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  55.84 
 
 		 320 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  56.29 
 
 		 311 aa  345  7e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  55.52 
 
 		 320 aa  345  7e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  54.26 
 
 		 318 aa  344  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  55.21 
 
 		 346 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  56.6 
 
 		 317 aa  343  2.9999999999999997e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  54.4 
 
 		 320 aa  342  4e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1360  thioredoxin reductase  54.57 
 
 		 332 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  54.89 
 
 		 320 aa  341  9e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  54.32 
 
 		 320 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  54.32 
 
 		 320 aa  341  1e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  54.32 
 
 		 320 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  55.74 
 
 		 310 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2342  thioredoxin reductase oxidoreductase protein  55.87 
 
 		 318 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0703  thioredoxin reductase  53.02 
 
 		 321 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0978  thioredoxin reductase  55.84 
 
 		 315 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.993828  normal  0.0140705 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0791  thioredoxin reductase  53.02 
 
 		 321 aa  339  4e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  55.52 
 
 		 318 aa  338  7e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2028  thioredoxin reductase  52.68 
 
 		 316 aa  338  7e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102058  hitchhiker  0.0000262597 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  54.57 
 
 		 320 aa  338  7e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  54.26 
 
 		 319 aa  338  8e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  52.98 
 
 		 311 aa  337  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  55.84 
 
 		 319 aa  337  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1982  thioredoxin reductase  53.07 
 
 		 328 aa  336  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.343784  normal  0.438815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>