More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0228 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  100 
 
 		 317 aa  640    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  100 
 
 		 312 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  90.97 
 
 		 335 aa  595  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  81.29 
 
 		 331 aa  543  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  79.61 
 
 		 332 aa  520  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  77.74 
 
 		 313 aa  512  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2208  thioredoxin reductase  80.33 
 
 		 338 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  72.03 
 
 		 314 aa  454  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  68.59 
 
 		 334 aa  438  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  68.85 
 
 		 321 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  69.18 
 
 		 321 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  67.42 
 
 		 321 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  68.49 
 
 		 321 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  67.2 
 
 		 321 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  67.41 
 
 		 321 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  65.7 
 
 		 325 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  68.61 
 
 		 335 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  63.67 
 
 		 324 aa  418  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  66.24 
 
 		 321 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  67.1 
 
 		 325 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  63.34 
 
 		 324 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  63.34 
 
 		 324 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  64.94 
 
 		 345 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  67.74 
 
 		 320 aa  411  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0563  thioredoxin reductase  65.06 
 
 		 326 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0552475  normal  0.0148693 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  61.54 
 
 		 324 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  62.78 
 
 		 317 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  61.22 
 
 		 324 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  62.7 
 
 		 322 aa  398  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  61.22 
 
 		 324 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  63.34 
 
 		 314 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  61.02 
 
 		 321 aa  395  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  61.86 
 
 		 324 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  58.39 
 
 		 326 aa  395  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  60.57 
 
 		 316 aa  392  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  61.34 
 
 		 323 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  60.25 
 
 		 316 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  60.66 
 
 		 326 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2959  thioredoxin reductase  62.7 
 
 		 317 aa  388  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.457436  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  58.84 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  57.73 
 
 		 314 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  60.88 
 
 		 319 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  59.94 
 
 		 317 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  59.62 
 
 		 317 aa  378  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  58.99 
 
 		 316 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  58.68 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  60.82 
 
 		 318 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  58.79 
 
 		 342 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2389  thioredoxin reductase  59.31 
 
 		 316 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0722352 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0388  putative thioredoxin reductase  57.83 
 
 		 340 aa  375  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.457738  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  56.74 
 
 		 319 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1982  thioredoxin reductase  59.31 
 
 		 328 aa  374  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.343784  normal  0.438815 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  58.68 
 
 		 316 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1499  thioredoxin reductase  60.77 
 
 		 324 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.770592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1360  thioredoxin reductase  58.13 
 
 		 332 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1664  thioredoxin reductase  61.09 
 
 		 324 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28715  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  60.57 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  59.06 
 
 		 323 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00892  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  59.06 
 
 		 321 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  59.06 
 
 		 321 aa  368  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  60.5 
 
 		 320 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  55.84 
 
 		 320 aa  368  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  58.15 
 
 		 352 aa  368  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06129  thioredoxin-disulfide reductase  59.11 
 
 		 322 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345376  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  59.38 
 
 		 321 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0703  thioredoxin reductase  58.86 
 
 		 321 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  59.06 
 
 		 321 aa  368  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  59.06 
 
 		 321 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  60.5 
 
 		 320 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0981  thioredoxin-disulfide reductase  59.94 
 
 		 317 aa  370  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.708131  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1023  thioredoxin reductase  59.69 
 
 		 322 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00170984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  60.5 
 
 		 320 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  59.06 
 
 		 321 aa  368  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  60.5 
 
 		 320 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  59.69 
 
 		 322 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  55.84 
 
 		 320 aa  368  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01037  thioredoxin-disulfide reductase  59.11 
 
 		 322 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.088167  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0429  thioredoxin reductase  56.55 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.749384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0791  thioredoxin reductase  58.86 
 
 		 321 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0963  thioredoxin reductase  59.69 
 
 		 322 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000679645  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1057  thioredoxin reductase  59.69 
 
 		 322 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00951777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  57.1 
 
 		 316 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1050  thioredoxin reductase  59.06 
 
 		 321 aa  368  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000235297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  54.98 
 
 		 314 aa  368  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  59.06 
 
 		 321 aa  368  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1072  thioredoxin reductase  59.69 
 
 		 322 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00976208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  58.31 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  59.62 
 
 		 318 aa  365  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3383  thioredoxin reductase  59.62 
 
 		 317 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  60.5 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  59.62 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  57.32 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1932  thioredoxin reductase  58.28 
 
 		 323 aa  367  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5364  thioredoxin reductase  58.68 
 
 		 337 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  59.62 
 
 		 317 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2441  thioredoxin reductase  58.75 
 
 		 321 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000126981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28230  thioredoxin-disulfide reductase  59.94 
 
 		 315 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.75824  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  58.31 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  58.31 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3427  thioredoxin reductase  59.31 
 
 		 319 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116946  normal  0.610265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>