More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4536 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  100 
 
 		 348 aa  700    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  76.22 
 
 		 348 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  75.25 
 
 		 310 aa  478  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  72.7 
 
 		 319 aa  477  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  72.37 
 
 		 310 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  75 
 
 		 309 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  70.49 
 
 		 310 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  65.73 
 
 		 359 aa  435  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  68.85 
 
 		 340 aa  434  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  68.08 
 
 		 346 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  71.8 
 
 		 327 aa  434  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  69.31 
 
 		 332 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  69.26 
 
 		 325 aa  426  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  69.31 
 
 		 330 aa  423  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  67.99 
 
 		 333 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  70.78 
 
 		 344 aa  417  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  67.94 
 
 		 329 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  64.17 
 
 		 310 aa  411  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  65.47 
 
 		 333 aa  412  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  65.69 
 
 		 313 aa  414  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  65.3 
 
 		 330 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  65.47 
 
 		 353 aa  414  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  66.45 
 
 		 331 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  66.03 
 
 		 336 aa  408  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  63.41 
 
 		 331 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  63.41 
 
 		 333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  63.41 
 
 		 333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  63.41 
 
 		 333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  63.28 
 
 		 318 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  68.52 
 
 		 317 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  63.16 
 
 		 330 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  64.48 
 
 		 362 aa  398  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  63.82 
 
 		 318 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  66.25 
 
 		 317 aa  398  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  62.65 
 
 		 361 aa  399  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  65.29 
 
 		 320 aa  397  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  68.21 
 
 		 325 aa  395  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  68.21 
 
 		 329 aa  391  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  60.06 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  62.7 
 
 		 335 aa  375  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  65.82 
 
 		 327 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  59.74 
 
 		 319 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  60.53 
 
 		 325 aa  364  1e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  58.22 
 
 		 311 aa  361  1e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  60.2 
 
 		 318 aa  360  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  56.03 
 
 		 311 aa  360  2e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  57.14 
 
 		 311 aa  358  5e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  57.65 
 
 		 311 aa  357  9.999999999999999e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  57.67 
 
 		 314 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  57.33 
 
 		 314 aa  352  5e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  56.07 
 
 		 311 aa  351  8.999999999999999e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  53.75 
 
 		 311 aa  348  9e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  56.03 
 
 		 313 aa  346  4e-94  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  57.52 
 
 		 325 aa  345  8e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  57.95 
 
 		 332 aa  344  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  55.05 
 
 		 311 aa  344  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  51.97 
 
 		 315 aa  339  4e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  57 
 
 		 314 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  51.78 
 
 		 456 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  55.81 
 
 		 333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  54.05 
 
 		 458 aa  335  5e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  52.09 
 
 		 460 aa  335  7e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  51.14 
 
 		 453 aa  333  4e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  55.59 
 
 		 321 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  56.39 
 
 		 320 aa  331  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  52.12 
 
 		 319 aa  331  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  52.27 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  52.44 
 
 		 324 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  52.77 
 
 		 324 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  57 
 
 		 314 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  50.83 
 
 		 326 aa  326  4.0000000000000003e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  54.28 
 
 		 320 aa  323  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  50.49 
 
 		 461 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  53.27 
 
 		 325 aa  323  3e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  50.49 
 
 		 461 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  49.01 
 
 		 314 aa  321  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  51.64 
 
 		 322 aa  321  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  50.64 
 
 		 323 aa  320  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  51.09 
 
 		 335 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  51.79 
 
 		 314 aa  318  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  52.63 
 
 		 312 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  52.63 
 
 		 317 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  54.28 
 
 		 321 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  52.44 
 
 		 313 aa  316  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  54.07 
 
 		 314 aa  316  3e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  51.82 
 
 		 322 aa  316  4e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  51.17 
 
 		 320 aa  316  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  51.27 
 
 		 324 aa  316  5e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  51.16 
 
 		 321 aa  316  5e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  49.84 
 
 		 317 aa  315  6e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  52.96 
 
 		 345 aa  315  6e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  52.26 
 
 		 314 aa  315  7e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  50.16 
 
 		 316 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0703  thioredoxin reductase  52.09 
 
 		 321 aa  315  8e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  49.4 
 
 		 339 aa  315  8e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0791  thioredoxin reductase  52.09 
 
 		 321 aa  315  9e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2389  thioredoxin reductase  49.84 
 
 		 316 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0722352 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  51.82 
 
 		 321 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  50 
 
 		 324 aa  314  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  51.27 
 
 		 324 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>