More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2441 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  100 
 
 		 345 aa  700    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  72.52 
 
 		 361 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  68.69 
 
 		 325 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  67.96 
 
 		 321 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  66.67 
 
 		 322 aa  444  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  70.49 
 
 		 314 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  68.65 
 
 		 321 aa  437  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  69.68 
 
 		 314 aa  440  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  65.81 
 
 		 323 aa  432  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  66.56 
 
 		 321 aa  434  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  67.19 
 
 		 321 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  69.48 
 
 		 325 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  64.47 
 
 		 321 aa  432  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  67.21 
 
 		 324 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  66.89 
 
 		 324 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  65.19 
 
 		 321 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  65.62 
 
 		 321 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  67.54 
 
 		 331 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  64.87 
 
 		 321 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  66.23 
 
 		 324 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  67.54 
 
 		 334 aa  427  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  67.75 
 
 		 320 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  68.52 
 
 		 335 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0563  thioredoxin reductase  67.32 
 
 		 326 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0552475  normal  0.0148693 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  63.38 
 
 		 324 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  63.38 
 
 		 324 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  64.94 
 
 		 317 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0981  thioredoxin-disulfide reductase  65.8 
 
 		 317 aa  417  9.999999999999999e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.708131  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  61.18 
 
 		 326 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  63.82 
 
 		 326 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  64.94 
 
 		 312 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  64.94 
 
 		 324 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  62.1 
 
 		 324 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  65.13 
 
 		 332 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  63.31 
 
 		 335 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  60.19 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  61.24 
 
 		 314 aa  401  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  60.95 
 
 		 313 aa  395  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1664  thioredoxin reductase  61.71 
 
 		 324 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28715  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1499  thioredoxin reductase  61.08 
 
 		 324 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.770592  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0558  thioredoxin-disulfide reductase  63.19 
 
 		 314 aa  387  1e-106  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0735  thioredoxin-disulfide reductase  60.32 
 
 		 318 aa  384  1e-106  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2208  thioredoxin reductase  63.52 
 
 		 338 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0331  thioredoxin reductase  59.37 
 
 		 321 aa  384  1e-105  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  60.45 
 
 		 317 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  59.55 
 
 		 317 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  58.5 
 
 		 314 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  58.5 
 
 		 314 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  59.68 
 
 		 316 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  60 
 
 		 316 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2959  thioredoxin reductase  61.61 
 
 		 317 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.457436  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  59.35 
 
 		 318 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  57.5 
 
 		 323 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  57.5 
 
 		 323 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  57.61 
 
 		 320 aa  366  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  57.61 
 
 		 320 aa  366  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1450  thioredoxin-disulfide reductase  60.76 
 
 		 324 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0791  thioredoxin reductase  60.13 
 
 		 321 aa  365  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0755  thioredoxin reductase  61.69 
 
 		 315 aa  364  1e-99  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0703  thioredoxin reductase  59.81 
 
 		 321 aa  364  2e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  58.84 
 
 		 317 aa  362  3e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  57.74 
 
 		 314 aa  361  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  58.92 
 
 		 319 aa  361  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  58.69 
 
 		 334 aa  360  2e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  56.77 
 
 		 319 aa  359  4e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  56.77 
 
 		 316 aa  358  5e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0388  putative thioredoxin reductase  55.81 
 
 		 340 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.457738  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2389  thioredoxin reductase  56.59 
 
 		 316 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0722352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  56.77 
 
 		 316 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  58.71 
 
 		 316 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  57.1 
 
 		 342 aa  356  3.9999999999999996e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  59.35 
 
 		 320 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  57.56 
 
 		 321 aa  355  7.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4032  thioredoxin reductase  56.83 
 
 		 316 aa  354  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000634849  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  57.28 
 
 		 352 aa  354  1e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  58.71 
 
 		 319 aa  354  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  57.32 
 
 		 316 aa  353  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000407332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  58.82 
 
 		 314 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  58.71 
 
 		 320 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0429  thioredoxin reductase  55.48 
 
 		 340 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.749384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2017  thioredoxin reductase  57.56 
 
 		 317 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000213161  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  58.71 
 
 		 346 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  57.56 
 
 		 317 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000827938  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  52.81 
 
 		 314 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  58.39 
 
 		 320 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  58.39 
 
 		 320 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  58.39 
 
 		 320 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1959  thioredoxin reductase  57.23 
 
 		 317 aa  352  5e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000155114  normal  0.552411 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  57.37 
 
 		 323 aa  352  5.9999999999999994e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  54.97 
 
 		 311 aa  352  7e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  57.84 
 
 		 314 aa  352  8e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  57.96 
 
 		 317 aa  351  8.999999999999999e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  58.06 
 
 		 320 aa  351  8.999999999999999e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2028  thioredoxin reductase  57.1 
 
 		 316 aa  350  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102058  hitchhiker  0.0000262597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3213  thioredoxin reductase  57.23 
 
 		 314 aa  351  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.166551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3328  thioredoxin reductase  57.88 
 
 		 318 aa  351  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  56.91 
 
 		 317 aa  350  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2486  thioredoxin reductase  56.13 
 
 		 318 aa  350  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000100803  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  56.05 
 
 		 316 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  56.91 
 
 		 317 aa  350  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>